Jove
Visualize
お問い合わせ
JoVE
x logofacebook logolinkedin logoyoutube logo
JoVEについて
概要リーダーシップブログJoVEヘルプセンター
著者向け
出版プロセス編集委員会範囲と方針査読よくある質問投稿
図書館員向け
推薦の声購読アクセスリソース図書館諮問委員会よくある質問
研究
JoVE JournalMethods CollectionsJoVE Encyclopedia of Experimentsアーカイブ
教育
JoVE CoreJoVE BusinessJoVE Science EducationJoVE Lab Manual教員リソースセンター教員サイト
利用規約
プライバシーポリシー
ポリシー

関連する概念動画

The DNA Helix01:16

The DNA Helix

Overview
The DNA Helix01:16

The DNA Helix

Overview
The DNA Helix01:07

The DNA Helix

Deoxyribonucleic acid, or DNA, is the genetic material responsible for passing traits from generation to generation in all organisms and most viruses. DNA is composed of two strands of nucleotides that wind around each other to form a spring-like structure called a double helix. However, the double helix is not perfectly symmetrical. Instead, there are regularly occurring grooves in the structure. The major groove occurs where the sugar-phosphate backbones are relatively far apart. This space...
Generation of Straight or Branched Actin Filaments01:14

Generation of Straight or Branched Actin Filaments

The straight or branched structure formation of actin filaments is controlled by nucleating proteins such as the formins and Arp2/3 complex. Formin-mediated assembly results in straight filaments, whereas Arp2/3 protein complex-mediated assembly results in branched actin filaments.
Arp2/3 Complex
Arp2/3 complex is a seven-subunit complex consisting of two proteins similar to actin- Arp2 and Arp3, and five other subunits that help keep Arp2 and Arp3 inactive. When required, the complex is...
Protein Folding01:22

Protein Folding

Overview
Protein Folding01:22

Protein Folding

Overview

こちらも読む

関連記事

共著者、ジャーナル、引用グラフによってこの研究に関連する記事。

並び替え
Same author

Nonequilibrium Theory for Molecular Machine Design.

ArXiv·2026
Same author

Seeking Biology's Physics Stories: Simplify, Simplify.

Annual review of biophysics·2026
Same author

A principled basis for nonequilibrium network flows.

Nature communications·2026
Same author

Fluctuation-Response Design Rules for Nonequilibrium Flows.

ArXiv·2026
Same author

"Excluded phenotypes" restrict genetic paths toward adaptation in declining populations.

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America·2026
Same author

Modeling Protein-Protein and Protein-Ligand Interactions by the ClusPro Team in CASP16.

Proteins·2025

関連する実験動画

Updated: Jul 16, 2026

Scalable Nanohelices for Predictive Studies and Enhanced 3D Visualization
08:03

Scalable Nanohelices for Predictive Studies and Enhanced 3D Visualization

Published on: November 12, 2014

動的プログラミングアプローチを用いたヘリックスバンドルの統計力学.

Adam Lucas1, Liang Huang, Aravind Joshi

  • 1Department of Mathematics, Saint Mary's College of California, Moraga, California 94575-3517, USA.

Journal of the American Chemical Society
|March 17, 2007
PubMed
まとめ

新しいダイナミックプログラミングモデルは,鎖の崩壊や二次構造の形成を含む,バイオ分子折り畳み協力性を正確に予測します. このモデルは,ペプチドやタンパク質におけるヘリックス・コイルとヘリックス・バンドルの折り畳み移行をうまく説明しています.

科学分野:

  • バイオフィジックス 生物物理学
  • コンピュータ生物学 コンピュータ生物学
  • ポリマーサイエンスの科学

背景:

  • 生物分子の折り畳み協同性は,未だに十分に理解されていない.
  • 既存のモデルは,チェーン崩壊と二次構造形成の両方を同時に扱うのに正確性が欠けている.
  • ヘリックスコイルとコイルから球体への移行には定量モデルが存在するが,統合的アプローチは存在しない.

研究 の 目的:

  • 折りたたみ連鎖分子折りたたみ協同性を予測するための正確なモデルを開発する.
  • 二次構造形成と連鎖崩壊現象を統一モデルに統合する.
  • このモデルをペプチドとタンパク質におけるヘリックスコイルとヘリックスバンドルの折り畳みを分析するために適用する.

主な方法:

  • 折りたたみ連鎖のための統計的機械分割関数を計算するためのダイナミックプログラミングアプローチを開発しました.
  • このアプローチをアセンダント・レベル・モデル (ALM) と命名した.
  • 様々なペプチドおよびタンパク質システムにおける協力性を含むヘリックスコイルおよびヘリックスバンドル折り畳みを分析するためにALMを適用しました.

主要な成果:

  • ALMは,ボールドウィンペプチド (14〜50メル) の熱容量とヘリシティと温度と尿素を正確に予測します.

さらに関連する動画

DNA Nanotubes as a Versatile Tool to Study Semiflexible Polymers
08:00

DNA Nanotubes as a Versatile Tool to Study Semiflexible Polymers

Published on: October 25, 2017

Protein WISDOM: A Workbench for In silico De novo Design of BioMolecules
10:58

Protein WISDOM: A Workbench for In silico De novo Design of BioMolecules

Published on: July 25, 2013

関連する実験動画

Last Updated: Jul 16, 2026

Scalable Nanohelices for Predictive Studies and Enhanced 3D Visualization
08:03

Scalable Nanohelices for Predictive Studies and Enhanced 3D Visualization

Published on: November 12, 2014

DNA Nanotubes as a Versatile Tool to Study Semiflexible Polymers
08:00

DNA Nanotubes as a Versatile Tool to Study Semiflexible Polymers

Published on: October 25, 2017

Protein WISDOM: A Workbench for In silico De novo Design of BioMolecules
10:58

Protein WISDOM: A Workbench for In silico De novo Design of BioMolecules

Published on: July 25, 2013

  • このモデルは,温度とグアニジンを用いて特定の3ヘリックスバンドルタンパク質 (F13W*とalpha3C) の変性化に適しています.
  • これは,これらのタンパク質の2つの状態の折り畳み移行を予測し,ボールドウィンヘリクスのほぼ高次の移行と,3つのヘリクスのバンドルポリペプチドの反協力折り畳みを予測します.

    • 結論:

    • アセンダント・レベル・モデルは,複雑な折りたたみポリマーにおける協同性を探求するための一般的で正確な方法を提供します.
    • このモデルは,2ヘリクスのバンドルのタンパク質とペプトイドの安定性差を含むコンフォメーション分布と折り畳み行動の予測に成功した.
    • このアプローチは,生物分子折り畳み機構と協同性の理解を進めます.