定量プロテオミクスのためのSILACマウスは,赤血球機能の重要な要因としてkindlin-3を発見しました
Marcus Krüger1, Markus Moser, Siegfried Ussar
1Department of Proteomics and Signal Transduction, Max-Planck-Institute for Biochemistry, 82152 Martinsried, Germany.
Cell
|July 30, 2008
まとめ
細胞培養におけるアミノ酸による安定同位体ラベリング (SILAC) は,4世代に渡ってマウスをラベリングするために使用されました. この新しいSILAC-マウスアプローチは,インビボタンパク質機能の研究のための定量的なタンパク質比較を可能にします.
科学分野:
- プロテオミクス プロテオミクスは,プロテオミクスの
- バイオケミストリー バイオケミストリー
- 分子生物学は分子生物学である.
背景:
- 細胞培養におけるアミノ酸による安定同位体ラベル付け (SILAC) は,質量スペクトロメトリー (MS) ベースの定量プロテオミクスの重要な技術である.
- SILACのin vivoの応用は限られており,包括的なタンパク質解析のための新しい動物モデルの開発が必要である.
研究 の 目的:
- 複数の世代に渡ってマウス全体をラベリングするためのSILACベースの方法を開発する.
- 生涯に渡るSILACラベリングが動物の発達と生理学に与える可能性と影響を評価する.
- ノックアウトマウスの定量プロテオミクス分析のためにSILACマウスモデルを利用して,タンパク質の機能を in vivoで決定する.
主な方法:
- ネズミは,4世代に渡って,天然または13C(6) -ライシンを含むダイエットを用いてラベル付けされました.
- 質量スペクトロメトリ (MS) を使用して,血液細胞と臓器におけるタンパク質の組み込み率を決定しました.
- SILAC分析は,特定のタンパク質 (例えば,β1インテグリン,β-パービン,Kindlin-3) が欠けているノックアウトマウスからの様々な臓器で行われました.
主要な成果:
- マウスの完全なラベリングはF2世代で達成され,発達,成長,または行動に悪影響はありません.
- 多発性硬化症の分析により,さまざまな組織で高いタンパク質吸収率が確認されました.
- ノックアウトマウスのSILAC分析により,タンパク質の欠如が確認され,Kindlin-3欠乏性赤血球の赤血球膜骨格の構造的欠陥が明らかになった.
結論:
- SILACマウスアプローチは,in vivoの定量タンパク質学的研究のための堅牢で汎用的なツールです.
- この方法は,複雑な生物学的システムにおけるタンパク質と経路の機能的特徴づけを可能にします.
- SILACマウスモデルは,遺伝疾患を調査し,治療標的を特定するための新しい道筋を提供します.


