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酵母における遺伝子選択によるNGFI-BのDNA結合部位の特定
T E Wilson1, T J Fahrner, M Johnston
1Department of Pathology, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO 63110.
まとめ
新しい酵母系は,NGFI-B.のようなタンパク質のDNA結合部位を特定する. この方法により,NGFI-B応答要素 (NBRE) が発見され,このホルモン受容体スーパーファミリーのメンバーによる遺伝子調節を理解するために重要である.
科学分野:
- 分子生物学は分子生物学である.
- 遺伝学 遺伝学とは
- バイオケミストリー バイオケミストリー
背景:
- DNA結合タンパク質は,遺伝子調節において重要な役割を果たします.
- 特定のDNA結合部位を特定することは,タンパク質の機能を理解するために不可欠です.
- NGFI-Bタンパク質はステロイド-甲状腺ホルモン受容体スーパーファミリーのメンバーで,DNA結合特異性はほとんど不明です.
研究 の 目的:
- DNA結合タンパク質の標的を特定するためのインビボ選択システムを開発し,検証する.
- NGFI-Bタンパク質の特定のDNA結合部位を特定するために.
- NGFI-B結合部位の機能的性質と,そのタンパク質との相互作用を特徴づける.
主な方法:
- in vivo酵母選択システムの開発.
- 既知のDNA結合タンパク質GCN4を用いたシステムの検証.
- NGFI-B結合部位を含むラットゲノムDNA断片をキメリックアクティベーターを用いて分離.
- 転写活性化を評価するために哺乳類の細胞における共伝染実験.
主要な成果:
- DNA結合部位のインビボ選択システムを成功裏に開発し,検証しました.
- NGFI-Bタンパク質の特定のDNA結合部位を特定し,NGFI-B応答要素 (NBRE) と呼ばれる.
- NBREは,他の関連する核受容体の結合要素とは機能的に異なる.
- NGFI-Bは,そのリガンド結合領域に関係なく,哺乳類の細胞におけるNBREからの転写を活性化します.
結論:
- 開発された酵母選択システムは,新しいタンパク質のDNA結合部位を特定するのに有効です.
- NGFI-B応答要素 (NBRE) が特定され,特徴づけられました.
- NGFI-Bは,NBREを通して転写を調節することができ,遺伝子発現におけるその役割を強調します.
- NGFI-BがDNAを結合し,転写を活性化するには,DNA結合ドメインだけで十分です.