サイトクロームcにおけるリガンド動態の直接観察
Megan C Thielges1, Jörg Zimmermann, Floyd E Romesberg
1Department of Chemistry, The Scripps Research Institute, 10550 North Torrey Pines Road, La Jolla, California 92037, USA.
Journal of the American Chemical Society
|April 14, 2009
まとめ
この研究では,タンパク質の折りたたみではなく,COリガンドの急速なダイナミクスが,CO光解離後の馬心細胞クロームcの早期スペクトル変化を誘発していることが明らかになりました. これらの発見は,タンパク質の折りたたみ動力学と鎖間拡散率の解釈に影響を与えます.
科学分野:
- バイオケミストリー バイオケミストリー
- タンパク質のダイナミクス
- スペクトル顕微鏡検査です.
背景:
- ホースハート・サイトクロームc (cyt c) は,そのヘム群により,タンパク質の折り畳み研究のためのモデルである.
- 以前の研究では,タンパク質の折りたたみとヘム結合に起因するCO光解離後の4つの移行を解決しました.
研究 の 目的:
- 炭素一酸化物 (CO) のリガンドダイナミクスを含むフォト解離後のステップを明確に決定する.
- 初期のスペクトル変化がタンパク質の折りたたみやCOリガンドの振る舞いを反映しているかどうかを明確にするために.
主な方法:
- CO振動をモニタリングするために,ステップスキャンのフーリエ変換赤外線 (FT-IR) スペクトロスコーピーを利用しました.
- CO-boundの展開型サイトクから調査されたCO光解離.
主要な成果:
- 50〜100マイクロ秒のタイムスケールのプロセスは,タンパク質のダイナミクスではなく,COリガンドのダイナミクスに関連しています.
- 観測されたスペクトルの変化は,CO リバインディングまたは結合したCO リガンドの環境の変化を含む.
- 素早いゲミナートCO再結合後のHis18再結合は,観測された変化の説明であると考えられます.
結論:
- 50-100マイクロ秒の時間常数は,連鎖間の拡散率を測定するために使用すべきではありません.
- タンパク質の折り畳み研究において,高構造解像度の探査機の必要性を強調する.
- 細胞染色体cにおけるタンパク質折りたたみ現象とヘム結合の動態を区別する.
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