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Updated: Jun 21, 2026
11:12
Identification of protein complexes with quantitative proteomics in S. cerevisiae
Published on: March 4, 2009
標的型プロテオミクスによるS. cerevisiaeのフルダイナミックレンジプロテオーム解析
Paola Picotti1, Bernd Bodenmiller, Lukas N Mueller
1Institute of Molecular Systems Biology, ETH Zurich, Zurich CH 8093, Switzerland.
Cell
|August 12, 2009
まとめ
選択反応モニタリング (SRM) プロテオミクスは,酵母中の少量のタンパク質の感度のある検出と定量化を可能にします. この標的型アプローチは,さまざまなタンパク質濃度における高通量分析の古典的方法を超えています.
科学分野:
- プロテオミクス プロテオミクスは,プロテオミクスの
- システム生物学 システム生物学
- バイオケミストリー バイオケミストリー
背景:
- システム生物学では,複数のサンプルで敏感で迅速で一貫したタンパク質検出と定量化が必要である.
- 古典的な質量スペクトロメトリと親和性ベースの方法は,これらの要求を部分的に満たしています.
- 低濃度タンパク質を分析するための高度な技術が必要である.
研究 の 目的:
- タンパク質の検出と定量化のために選択反応モニタリング (SRM) を使用した標的型プロテオミクスアプローチを適用する.
- Saccharomyces cerevisiaeにおける50コピー/細胞以下の濃度でタンパク質を分析するためのSRMの能力を評価する.
- タンパク質ネットワークの高通量,定量的な測定のためのSRMの有用性を実証するために.
主な方法:
- 選択反応モニタリング (SRM) に基づく標的型プロテオミクスを利用しました.
- Saccharomyces cerevisiaeの全消化物を分析した.
- 様々な代謝段階をカバーする成長の時間コース全体で測定されたタンパク質の豊富さ.
主要な成果:
- 50コピー/細胞以下の濃度で表現されたタンパク質を検出・定量化することに成功しました.
- 検出範囲を1桁のコピー/細胞に拡張し,古典的な方法では見逃したタンパク質を特定しました.
- 豊富な範囲全体をカバーするタンパク質ネットワークの一貫性のある迅速な測定が実証されました.
結論:
- SRMベースの標的型プロテオミクスは,少量のタンパク質を検出および定量化するための優れた感度を提供します.
- このテクニックは,酵母中のタンパク質セットを分析するために,高通量と定量的精度を提供します.
- SRMプロテオミクスは,システム生物学の研究のための強力なツールであり,包括的なプロテオーム分析を可能にします.
