バクテリアの増強剤は,プロモーターの近くにある転写活性化剤を結合させる機能を持つ

科学分野:

• 分子生物学は分子生物学である.
• バクテリアの転写
• 遺伝子規制 遺伝子規制

背景:

• 窒素調節タンパク質NtrC (NtrC) は,腸内細菌におけるglnA遺伝子の転写を活性化するために重要である.
• NtrCは,閉じたRNAポリメラーゼ-プロモーター複合体の開いた複合体への変換を促進することによって機能します.
• NtrCは,強化剤のような性質を示す上流DNAサイトに結合する.

研究 の 目的:

• NtrC結合部位がglnA遺伝子転写を促進するメカニズムを調査する.
• DNAループがNtrC媒介の転写活性化に関与しているかどうかを判断する.
• RNAポリメラーゼ-プロモーター複合体の形成におけるNtrC-DNA相互作用の役割を明らかにする.

主な方法:

• DNAカテーネンを利用して,NtrC結合部位とglnAプロモーターを空間的に分離した.
• リンクされた DNA リングとリンクされていない DNA リングが,NtrC の転写活性化能力に与える影響を評価した.
• NtrCとRNAポリメラーゼの存在下でのオープンコンプレックス形成を分析した.

主要な成果:

• NtrCは,その結合部位とプロモーターが別々のリンクされたDNAリング上にあったときに,glnAプロモーターのオープンコンプレックス形成を容易にした.
• この促進は,DNAのリングが解鎖 (解き放たれた) されたときに廃止されました.
• これらの発見は,NtrCがRNAポリメラーゼプロモーター複合体と相互作用するためにDNAループを形成するモデルを支持する.

結論:

• glnA遺伝子のNtrC媒介の転写活性化は,DNAループの形成を伴う.
• アップストリームNtrC結合部位はテザーとして作用し,NtrCとRNAポリメラーゼ促進複合体間の近接と衝突頻度を増加させます.
• このDNAループメカニズムは,効率的なglnA遺伝子転写開始に不可欠です.