アイルランドのジャガイモの飢饉病原体であるPhytophthora infestansのゲノム配列と解析
Brian J Haas1, Sophien Kamoun, Michael C Zody
1Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Massachusetts 02141, USA.
Nature
|September 11, 2009
まとめ
Phytophthora infestansのゲノムは,最大級の配列化されたクロマルベオラートゲノムで,エフェクター遺伝子の急速な進化を明らかにしています. このゲノムの複雑さは,病原体の適応能力と,世界中のジャガイモの作物に対する壊滅的な影響を説明します.
科学分野:
- * ゲノミクスと病原体の進化
- * 植物病理学と農業科学
背景:
- *Phytophthora infestansは破壊的なオオミケート病原体で,重要な世界的な食糧作物であるジャガイモの遅い腐食を引き起こす.
- * この病原体は,歴史的にアイルランドのジャガイモの飢饉を引き起こし,依然として大きな経済的損失 (年間67億ドル) を引き起こしています.
- *P. infestansは驚くべき適応力を発揮し,耐性のある栽培品種のように困難な制御戦略を示しています.
研究 の 目的:
- *Phytophthora infestansのゲノム配列を報告するために.
- * P. infestansの急速な適応と進化の可能性のゲノム基盤を分析する.
主な方法:
- *Phytophthora infestans.の全ゲノムシーケンシングについて
- *他のPhytophthora種と比較したゲノム分析.
- *エフェクタータンパク質遺伝子ファミリーの識別と特徴付け.
主要な成果:
- * P. infestansのゲノムをシーケンスした (約. 240 Mb) で,これまでで最大で最も複雑な染色体ゲノムです.
- * 繰り返しDNAがゲノムの約74%を占め,その拡大に貢献することを発見した.
- * 感染中に誘発され,宿主操作に関与する多くのエフェクタータンパク質遺伝子ファミリーの急速な周回と拡張が特定されました.
結論:
- *P. infestansの広大で複雑なゲノム,広範囲にわたる繰り返しのDNAと拡張されたエフェクター遺伝子ファミリーによって特徴づけられ,その急速な適応性の基礎となっている.
- *ダイナミックなゲノム領域に位置する,急速に進化するエフェクター遺伝子は,病原体の進化的成功と農業への影響の鍵です.
