アジド-アルキンサイクロアディションによる生物分子のラベル付けのための割れるバイオチンプローブ
Janek Szychowski1, Alborz Mahdavi, Jennifer J L Hodas
1Division of Chemistry and Chemical Engineering, California Institute of Technology, 1200 East California Boulevard, Pasadena, California 91125, USA.
Journal of the American Chemical Society
|December 15, 2010
まとめ
新しい切断可能なバイオチン探査機は,バイオ分子にバイオオートゴナルラベリングを可能にします. 新しいダイアルコキシジフェニルシラン (DADPS) リンク器探査機は,タンパク質学の研究のために効率的な割れ方と最小質量タグ付けを提供します.
科学分野:
- バイオケミストリー バイオケミストリー
- 化学生物学 化学生物学とは
- プロテオミクス プロテオミクスは,プロテオミクスの
背景:
- アジド-アルキンサイクロアディションは,バイオ分子にラベルを付けるための重要なバイオ・オートゴーナル反応です.
- 切断可能な探査機は,タンパク質学の研究において,ラベル付けされた分子を放出するのに価値があります.
- 既存の探査機は,切断効率やタグサイズに制限がある可能性があります.
研究 の 目的:
- バイオ・オートゴーナル・ラベリングのための新しい割れるバイオチン・プローブの開発と評価.
- 異なるリンク器設計の割れ方効率と特徴を評価する.
- プロテオミクスとバイオ分子研究におけるアプリケーションのための最適な探査機を特定する.
主な方法:
- 異なるリンカー化学を備えた5つの切断可能なバイオチンプローブの合成.
- アジド・アルキン・サイクロアディションを用いたタンパク質およびその他のバイオ分子に対するバイオ・オートゴーナル・ラベル付け.
- 異なる化学条件 (減光剤,酸,紫外線照射) を使って,ラベル付きのバイオ分子を割る.
- 緑色光タンパク質のモデルを持つダイアルコキシジディフェニルシラン (DADPS) リンカープローブの評価.
主要な成果:
- 5つの切断可能なバイオチンプローブが成功裏に合成され,テストされました.
- 分裂は,Na2S2O4,2-メルカプトエタノール,キノコ酸,三酸,紫外線を含む様々な方法を使用して達成されました.
- DADPSのリンク器探査機は,0.5時間で10%のキノコ酸で効率的な割れ目を実証しました.
- DADPSの探査機は選択的結合を示し,分裂後に小さな143Da質量タグを残した.
結論:
- 斬新な割れるバイオチン探査機は,バイオオートゴーナルラベル付けと,その後のバイオ分子放出を促進します.
- DADPSのリンクセンサーは,高効率で選択性があり,プロテオミクスのアプリケーションに最適です.
- DADPSプローブの最小質量タグは,質量スペクトロメトリーベースの研究に有利です.
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