長いノンコーディングRNAは,ホメオティック遺伝子発現を調整するためにアクティブなクロマチンを維持します

科学分野:

• ゲノミクスゲノミクスとは
• 分子生物学は分子生物学である.
• エピジェネティクス エピジェネティクス

背景:

• ロングインタージェニック・ノンコーディングRNAs (lincRNAs) は,遺伝子調節,主に遺伝子サイレンシングにおける役割としてますます認識されています.
• 遺伝子の活性化,特に発達過程における lincRNAs の機能は,まだあまり理解されていません.
• 局所制御として知られる隣接する遺伝子の調整調節は,発達とホメオスタシスにとって極めて重要です.

研究 の 目的:

• 遺伝子活性化におけるlincRNAsの役割を調査し,特にロカス制御におけるそれらの潜在的な関与に焦点を当てた.
• ホックス遺伝子のクラスタの調節に関与する新しいlincRNAを特定し,特徴づけること.
• lincRNAsが長距離遺伝子の活性化を媒介するメカニズムを解明する.

主な方法:

• HOTTIPの識別と特徴付け,HOXAロカスから転写されたリンクRNAである.
• HOTTIPとその標的遺伝子の近接性を評価するために染色体ループの相互作用の分析.
• HOTTIP RNAとWDR5およびMLL複合体の相互作用を決定する生化学的分析.
• ヒストンH3ライシン4トリメチル化とHOTTIP発現に対する遺伝子転写の評価.

主要な成果:

• HOTTIPは,HOXA場所の5'尖端からのリンクRNAが特定されました.
• HOTTIPは5'HOXA遺伝子の活性化を vivoで調整する.
• 染色体ループは,HOTTIPの標的遺伝子との相互作用を容易にする.
• HOTTIP RNAはWDR5に直接結合し,WDR5/MLL複合体を採用してヒストンの改変と遺伝子転写を誘導する.

結論:

• lincRNAsは,長距離遺伝子の活性化を調整する重要な中間体として機能することができます.
• HOTTIPは,染色体改変によるlincRNA媒介遺伝子活性化のための新しいメカニズムを示しています.
• この研究は,開発中の調整された遺伝子発現のためのクロマチンのドメインの組織化におけるlincRNAsの可能性を強調しています.