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GCN4のDNA結合ドメインにおける折り畳み移行は,DNAへの特定の結合に起因する

M A Weiss¹, T Ellenberger, C R Wobbe

¹Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115.

|October 11, 1990

まとめ

イーストのトランスクリプションアクティベーターGCN4

科学分野:

分子生物学は分子生物学である.
バイオケミストリーバイオケミストリー
構造生物学構造生物学とは

背景:

タンパク質-DNA認識には,ヘリックス-ターン-ヘリックスや亜鉛指のような構造的モチーフがしばしば含まれます.
トランスクリプション因子は,ルシンジッパーやDNA結合のための基本領域などのモチーフを利用します.
イーストの転写活性化因子GCN4は,ユカリオット転写因子の保存された家族に属しています.

研究の目的:

GCN4 DNA結合ドメイン (GCN4-p) の構造特性を調査する.
DNA結合と構造的移行における基礎領域の役割を明らかにする.
GCN4-pが異なるDNA結合部位とどのように相互作用するかを理解する.

主な方法:

円形二重化スペクトロスコピーは,アルファ-ヘリカル含有量を評価する.
構造分析のためのプロトン核磁気共鳴 (1H-NMR) スペクトロスコピー.
異なる濃度のGCN4-pと特定のDNA配列の存在で実施された研究.

主要な成果:

GCN4-pは,濃度に依存するアルファヘリクスの移行を示し,二分化を示す.
GCN4-pダイマーは25°Cで約70%の螺旋形であり,基本領域は主に構造化されていない.
GCN4-pへのDNA結合は,アルファヘリックス含有量を少なくとも95%まで大幅に増加させ,基本領域を安定させます.

結論:

GCN4-pの基本領域は生理学的温度で展開され,DNA結合時に安定したアルファヘリル形状を採用します.
この折り畳み移行は,特定のタンパク質とDNAの相互作用を媒介するために重要である.
GCN4-pは,異なる長さのDNA標的部位に対応する柔軟性を示しています.

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