マウスの遺伝子機能の全ゲノム研究のための条件付きノックアウトリソース.
William C Skarnes1, Barry Rosen, Anthony P West
1Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SA, UK. skarnes@sanger.ac.uk
Nature
|June 17, 2011
まとめ
研究者らは,マウスの胚性幹細胞で,リポータータグ付きの条件性遺伝子アレルを作成するための高通量パイプラインを開発した. このスケーラブルな方法は,哺乳類の遺伝子機能を理解するための標的型変異の生成を加速します.
科学分野:
- ゲノミクスと分子生物学
- 哺乳類の遺伝学について
- 幹細胞生物学 幹細胞生物学
背景:
- 胚性幹細胞における遺伝子ターゲティングは,マウスのゲノム操作と条件付き変異生成において極めて重要です.
- 大規模なノックアウトプログラムは,すべてのタンパク質をコードする遺伝子の標的型変異の包括的なリソースを作成することを目的としています.
- 既存の方法は,多様なアレルの高通量生成のために最適化する必要があります.
研究 の 目的:
- レポータータグ付きの条件付きアレルを生成するための高通量遺伝子ターゲティングパイプラインを確立する.
- より広範な研究コミュニティのために標的型変異の生産を拡大する.
- 哺乳類の遺伝子機能を解読するための全ゲノム的な取り組みの基礎を築く.
主な方法:
- 計算型アレル設計を統合した高通量パイプラインの開発.
- 96wellのモジュールベクトル構造を使用して,効率的なアレル生成を実現します.
- 高効率の遺伝子ターゲティング戦略を用いて,生殖系統に適したC57BL/6N胚性幹細胞に
主要な成果:
- スケーラブルな遺伝子ターゲティングパイプラインの確立に成功した.
- 12,000以上のベクトルと9,000の条件付き標的アレルの生成.
- 高通量ゲノムエンジニアリング能力の実証.
結論:
- 開発されたパイプラインは,条件付き標的アレルを生成する前例のないスケールを可能にします.
- この高通量ゲノム工学のアプローチは,ネズミとヒトの幹細胞に適用できます.
- このリソースは,すべての哺乳類の遺伝子の機能を決定する将来の全ゲノム研究を促進します.
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