RNAポリメラーゼIIの最大のサブユニットにおけるヘプタド重複は,DNAにインターカレートすることによって結合する

科学分野:

• 分子生物学は分子生物学である.
• バイオケミストリー バイオケミストリー
• 遺伝学 遺伝学とは

背景:

• RNAポリメラーゼIIの最大のサブユニットは,C端のタンデムリピート (Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser-Tyr) を含んでいる.
• この繰り返しは,正常なポリメラーゼ機能に不可欠であり,11-23ユニットが必要である.
• このリピートの正確な機能的役割,特に転写因子との相互作用は不明である.

研究 の 目的:

• RNAポリメラーゼIIにおけるC端子リピートの機能的役割を調査する.
• 繰り返し配列がDNAに直接結合するかどうかを判断する.
• 繰り返しがDNAと相互作用するメカニズムを解明する.

主な方法:

• 1つまたは2つの繰り返し単位を含む合成ペプチドを用いた実験.
• 繰り返しユニットのベータターン構造をDNAインターカレーション薬と比較した構造モデリング.
• トリオスティンAの既知のDNA結合構造との比較.

主要な成果:

• C端の重複配列がDNAを結合することが示された.
• 証拠によると,DNA結合はチロシン残基のインターカレーションによって起こる.
• 構造モデルは,チロシン側鎖とトリオスティンAのDNA間隔キノキサリン環の重複を示しています.

結論:

• RNAポリメラーゼIIのC末端のリピートは,DNAを直接結合する.
• DNA結合は,繰り返し配列内のチロシン残基のインターキャラによって媒介されます.
• 既知のDNAインターカレーターとの構造的な類似性は,この結合メカニズムをサポートしています.