選択的なリボソームプロファイリングは,トリガーファクターのコトランスレーションチャペロン作用を in vivo で明らかにします
Eugene Oh1, Annemarie H Becker, Arzu Sandikci
1Howard Hughes Medical Institute, University of California, San Francisco, San Francisco, CA 94158, USA.
Cell
|December 14, 2011
まとめ
研究者らは,タンパク質加工因子を追跡するための新しいリボソームプロファイリング方法を開発しました. 研究によると,トリガー因子 (TF) は主に外膜タンパク質と結合し,約100個のアミノ酸が翻訳された後にリボソームと結合し,以前のモデルに挑戦しています.
科学分野:
- 分子生物学は分子生物学である.
- 細胞生物学 細胞生物学
- タンパク質の生体生成
背景:
- リボソームから発生する新生ポリペプチドは,様々な処理,ターゲティング,折り畳み因子と相互作用する.
- これらの相互作用の正確なタイミングと特異性を理解することは,タンパク質の生体生成にとって極めて重要です.
- 以前の in vitro 研究では,トリガーファクター (TF) がリボソームに先行結合していることが示唆されていた.
研究 の 目的:
- 新生ポリペプチドとの因子関わりのグローバルモニタリングのための選択的なリボソームプロファイリング戦略を開発する.
- Escherichia coli トリガーファクター (TF) のインビボ結合動力学と基板特異性を調査する.
- 共同翻訳タンパク質の転位と処理におけるTFの役割を明らかにする.
主な方法:
- 選択的なリボソームプロファイリング技術を開発し,in vivoで因子の関与を監視しました.
- この方法を適用して,Escherichia coli.におけるチャペロントリガーファクター (TF) を研究した.
- 外膜タンパク質バイオゲネシスとコトランスレーショントランスロケーションに対するTFの損失と過剰の影響を分析した.
主要な成果:
- TFの主要な基板としてβ-barrel外膜タンパク質を特定した.
- TFがリボソームを活性化させるのは,約100個のアミノ酸が変換された後にのみであることを実証し, in vitroの発見と矛盾しています.
- 広範な外膜の欠陥と,TFの損失による早期のコトランスレーション転移を観察した.
- 過剰なTFは,コトランスレーション処理中にN端末の形式メチオニン除去に干渉することを発見しました.
結論:
- TFのインビヴォ結合動態は,インビトロ予測と異なるが,ポリペプチド合成の後に発生する.
- TFは,外膜タンパク質のバイオゲネシスにおいて重要な役割を果たします.
- タンパク質の生体生成が,順次,微調整された因子の関与に依存するトリアージングモデルをサポートします.
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