ヒトのタンパク質をコードする遺伝子の機能喪失変異の体系的な調査
Daniel G MacArthur1, Suganthi Balasubramanian, Adam Frankish
1Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, UK. macarthur@atgu.mgh.harvard.edu
人間のゲノムは通常約100の機能喪失 (LoF) 変異体を含み,約20の遺伝子を不活性化する. この研究では,LoF変異の有病率を洗練し,臨床応用のための疾患関連アレルを特定しています.
科学分野:
- ゲノミクスゲノミクスとは
- 人間の遺伝学 人間の遺伝学
- バイオインフォマティックス
背景:
- ゲノム配列解析は,数多くの遺伝的変異を明らかにしています.
- 多くの変種が,タンパク質をコードする遺伝子の機能喪失 (LoF) を引き起こすと予測されています.
- これは,ヒトゲノム内の有意な冗長性を示唆しています.
研究 の 目的:
- 人間のゲノムにおけるLoF変異の有病率と特徴を正確に決定する.
- 重症疾患に関連するものを含め,希少かつ一般的なLoFアレルを識別する.
- 臨床シーケンシングにおける候補遺伝子の優先順位付けのための方法を開発する.
主な方法:
- 185のヒトゲノムから2951の推定のLoF変種に厳格なフィルターを適用する.
- LoF耐性遺伝子と後退性疾患遺伝子の機能的および進化的差異の分析.
主要な成果:
- 人間のゲノムには,典型的には約100の本物のLoF変異体があり,約20の遺伝子は完全に不活性化されています.
- 26の既知の変種と21の予測された重症疾患を引き起こす変種を含む,珍しいLoFアレルが特定されました.
- 非必須遺伝子の一般的なLoF変異を特徴づけました.
結論:
- 人間のゲノムにおけるLoF変異負荷の精巧な見積もりを提供します.
- 疾患に関連したアレルを含むLoF変異の臨床的関連性を強調します.
- 臨床シーケンシングデータの解釈を助けるための新しい方法を提供します.
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