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Histone Modification02:32

Histone Modification

The histone proteins have a flexible N-terminal tail extending out from the nucleosome. These histone tails are often subjected to post-translational modifications such as acetylation, methylation, phosphorylation, and ubiquitination. Particular combinations of these modifications form “histone codes” that influence the chromatin folding and tissue-specific gene expression.
Acetylation
The enzyme histone acetyltransferase adds acetyl group to the histones. Another enzyme, histone deacetylase,...

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単純な化学センサー配列を用いたヒストンコードの抗体なしの読み取り.

Samuel A Minaker1, Kevin D Daze, Manuel C F Ma

  • 1Department of Chemistry, University of Victoria, Victoria, British Columbia V8W 3V6, Canada.

Journal of the American Chemical Society
|June 19, 2012
PubMed
まとめ

この研究は,ヒストンの改変を検出するための染料の移位センサーの新しいツールキットを導入しています. これらの超分子センサーは,さまざまなヒストンのコード要素を識別することができ,病気の研究のための新しい方法を提供します.

科学分野:

  • バイオケミストリー バイオケミストリー
  • 化学生物学 化学生物学とは
  • 分子生物学は分子生物学である.

背景:

  • ヒストンの翻訳後の改変のネットワークであるヒストンコードは,遺伝子発現を調節し,多数のヒト疾患に関与しています.
  • 特定のヒストンの改変の正確な検出は,疾患のメカニズムを理解するために不可欠です.

研究 の 目的:

  • カチオンのペプチド,特にヒストンの改変を検出するための染料の移位センサーの汎用ツールキットを開発する.
  • これらのセンサーで構成された化学センサー配列が,さまざまなヒストンコード要素を堅牢に区別する能力を実証する.

主な方法:

  • 簡単に入手可能な染料とカリキサレン宿主分子を組み合わせたミックス・アンド・マッチアプローチで,染料移位センサーを作成します.
  • 2つまたは3つの超分子センサーからなる化学センサー配列を使用して,ヒストン改変分析のためのデータ指紋を生成します.
  • センサー配列を用いて,ヒストンの尾の異なる修正,修正の組み合わせ,および配列の文脈を識別する.

主要な成果:

  • センサー配列はヒストンの尾に非メチル化,モノ-,二-,および三メチル化ライシンを成功裏に区別しました.
  • システムは,単一ヒストンの尾の配列と異なる配列文脈内のさまざまな改変タイプと組み合わせを特定しました.

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  • また,同位体ダイメチルアルギニンの改変も特定され,抗体ベースの方法が直面する制限を克服しました.
  • 配列は同時にヒストンの改変の濃度と同一性を報告した.

    • 結論:

    • 超分子センサーの新しいツールキットは,多様なヒストンコード要素の堅牢な差別を可能にします.
    • このセンサー配列は,挑戦的なターゲットを含むヒストンの修正を分析するための強力で汎用的なプラットフォームを提供します.
    • 濃度とアイデンティティを同時に決定する能力は,表遺伝的調節と関連する疾患の研究を進めています.