常見の疾患に関連した,規制DNAの変異を系統的に局所化する
Matthew T Maurano1, Richard Humbert, Eric Rynes
1Department of Genome Sciences, University of Washington, Seattle, WA 98195, USA.
一般的な疾患は,特に胎児の発達中に活発な規制DNAの遺伝的変異と関連しています. これらの非コーディング変異は遺伝子調節に影響を与え,病気のメカニズムに関する洞察を提供し,病気を引き起こす細胞タイプを特定します.
科学分野:
- ゲノミクスゲノミクスとは
- エピジェネティクス エピジェネティクス
- 人間の遺伝学 人間の遺伝学
背景:
- 全ゲノム関連研究 (GWAS) では,一般的な疾患や特徴に関連した多数の非コーディング遺伝子変異が特定されています.
- これらの変異は,多くの場合,調節性DNA領域に存在しますが,それらの正確な機能的な影響は,まだ完全に理解されていません.
研究 の 目的:
- 常見の人間の疾患における規制性DNA要素内のノンコーディング変異の役割を調査する.
- これらの変異と関連した遺伝子ターゲットと病原性メカニズムを特定する.
主な方法:
- 制御DNAのマーカーとしてデオキシリボヌクレアゼI (DNase I) 過敏部位 (DHSs) の分析.
- 変種データをDHSの活性,遺伝子発現,染色体の状態情報と統合する.
- 遠隔の遺伝子ターゲットと規制ネットワークを特定するための計算方法.
主要な成果:
- 非コーディング疾患関連変異は,DHSに集中しており,胎児発達の過程で重要な割合が活性化しています.
- 変種を含むDHSは,妊娠中の暴露に関連する現象型と関連していた.
- 変種は,転写因子結合部位を混乱させ,クロマチンの状態を変更し,規制ネットワークを形成することが判明しました.
- 変異体の組織特異的濃縮により,クローン病,多発性硬化症,および心電図の特性の病原性細胞タイプが特定されました.
結論:
- 調節性DNAの変異は,一般的なヒト疾患において,広範囲にわたる役割を果たしています.
- これらの発見は,特定の細胞および発達的な文脈にノンコーディングの変異をリンクすることによって,さまざまな障害に対する病原学的洞察を提供します.
さらに関連する動画
04:41Mapping Alzheimer's Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration
Published on: January 9, 2020
09:34Targeted Next-generation Sequencing and Bioinformatics Pipeline to Evaluate Genetic Determinants of Constitutional Disease
Published on: April 4, 2018
関連する概念動画
Genome-wide Association Studies-GWAS
GWAS does not require the identification of the target gene involved in...
Pharmacogenomics: Identification of New Drug Targets
Comparing Copy Number Variations and SNPs
Copy number variations or CNVs are the structural variations that cover more than 1kb of DNA sequence. The single nucleotide polymorphism (SNP), on the other hand, is a single nucleotide change or a point mutation that is found in more than 1%...
Cis-regulatory Sequences
Modern Molecular Taxonomy
Principles of Pharmacogenetics: Types of Genetic Variants
