システム遺伝学とマクロファージにおける遺伝子環境相互作用を用いて炎症反応を解明する

科学分野:

• 免疫学 免疫学とは
• 遺伝学 遺伝学とは
• システム生物学 システム生物学

背景:

• マクロファージは,多くの一般的な疾患の炎症成分において重要な役割を果たします.
• マクロファージの炎症反応の遺伝的基礎を理解することは,病気の研究にとって極めて重要です.

研究 の 目的:

• 炎症刺激に対するマクロファージの反応に対する一般的な遺伝的変異の影響を調査する.
• マクロファージの炎症経路を制御する遺伝的位置と規制要素を特定する.

主な方法:

• システム遺伝学のアプローチでは,マウスの92種のマクロファージの全ゲノムにわたるトランスクリプトレベルを使用しています.
• マクロファージを制御媒介,細菌のリポポリサッカリド (LPS),または酸化フォスホリピドに曝露する.
• アソシエーションマッピングは,発現量的な特征ロシ (eQTL) と環境による遺伝子相互作用を特定するために行われ,その後,siRNAの検証が行われます.

主要な成果:

• 何千ものeQTL,環境による遺伝子相互作用,eQTLホットスポット,特にLPS応答の特定.
• 染色体8のeQTLホットスポットの検証で,マクロファージの炎症反応の調節体として2310061C15Rikを特定しました.
• 炎症性特徴と遺伝子調節に関するさらなる研究のための公共データベースの作成.

結論:

• 共通の遺伝的変異が,マクロファージの炎症反応を大きく左右する.
• 遺伝子2310061C15Rikは,マクロファージの炎症反応の新たなレギュレータである.
• 生成されたデータとデータベースは,炎症性疾患と遺伝子調節ネットワークの研究に貴重なリソースとなります.