ISWIの調節には,核群のエピトープによって敵対される抑制モジュールが含まれています

科学分野:

• 分子生物学は分子生物学である.
• エピジェネティクス エピジェネティクス
• バイオケミストリー バイオケミストリー

背景:

• 染色体改造複合体 (CRC) は,核細胞を動員することによって遺伝子調節に不可欠です.
• CRCは,触媒性ATPase/DNA-トランスロカゼサブユニットと,ヌクレオソームのエピトープを結合する規制的側面領域を有しています.
• これらの隣接する領域がCRCの活性を調節する方法を理解することは,遺伝子のアクセシビリティを解読する上で極めて重要です.

研究 の 目的:

• ISWI-ファミリークロマチンリモデラー内の新しい規制領域を特定し,特徴づけること.
• ヌクレオソームのエピトープがISWI活動を調節するメカニズムを調査する.
• 規制領域とISWIの触媒コアとの機能的関係を明らかにする.

主な方法:

• ATPの水解とDNAの転位率を測定するための生化学分析.
• ドロソフィラISWIの特定された調節領域 (AutoNとNegC) を破壊または除去するためのサイト指向変異.
• 特定の核染色体エピトープ (H4テイルベーシックパッチ,エクストラヌクレオソームDNA) の存在または欠如における核染色体スライディングアッセイ.

主要な成果:

• Drosophila ISWI.で2つの新しい保存された規制領域,AutoNとNegCが特定されました.
• AutoNはATPの水解を否定的に調節し,NegCは水解とDNA転位の結合を阻害する.
• AutoNとNegCの除去により,ISWIは活性化エピトープとHSSドメインに独立して核細胞をスライドし,SWI/SNF ATPaseの活動を模倣することができます.

結論:

• ISWI ATPaseの触媒核は本質的に活性であり,AutoNとNegCは抑制モジュールとして作用する.
• 核群のエピトープは,AutoNとNegCによって課される抑制を緩和することによって,ISWI活動を促進します.
• このメカニズムは,ISWIファミリーのリモデラーが適切なクロマチンの風景に選択的に作用することを保証し,クロマチンのリモデラーの専門化に貢献します.