生体細胞内のエンジニアリングされたポストトランスレーション装置による全ゲノムクロマチンのメチル化プロファイリング
Rui Wang1, Kabirul Islam, Ying Liu
1Molecular Pharmacology and Chemistry Program, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, New York, New York 10065, USA.
Journal of the American Chemical Society
|December 19, 2012
まとめ
研究者は,生きている細胞における特定のタンパク質メチルトランスファーゼ (PMT) 活動をマッピングするために,パラレルDNAシーケンシング (CliEn-seq) によるクリック可能なクロマチン濃縮という新しい方法を開発しました. この技術は,これらの重要な表遺伝子調節体を研究する際の制限を克服します.
科学分野:
- エピジェネティクス エピジェネティクス
- 分子生物学は分子生物学である.
- バイオケミストリー バイオケミストリー
背景:
- タンパク質メチルトランスファーゼ (PMT) は,様々な生物学的プロセスや疾患に関与する重要な表遺伝子調節因子である.
- 個々のPMT機能をin vivoで理解することは,重複し,非冗長な活動と現在の方法の限界のために困難です.
- 特定のPMT媒介の染色体変異をマッピングするには,高度な技術が必要です.
研究 の 目的:
- 生体細胞内の個々のPMTによる全ゲノムクロマチンの改変を調査するための新しい技術を開発する.
- PMT in vivo活動の研究における従来のアプローチの限界を克服するために.
- エピジェネティック・レギュレーションの正確な分析のためのツールを提供すること.
主な方法:
- パラレルDNAシーケンシング (CliEn-seq) によるクリック可能なクロマチン濃縮と呼ばれる新技術を開発した.
- エンジニアリングされたSAM合成酵素 (メチオニンアデノシルトランスフェラーゼまたはMAT) を使用したS-アデノシル-L-メチオニン (SAM) アナログのインビボ合成を含む3段階のアプローチを開発しました.
- インサイトクロマチンの改変のためのエンジニアリング PMT を使用し,その後,独特に改変されたクロマチンの濃縮と配列化を行いました.
主要な成果:
- ゲノム全体のクロマチンの改変をマッピングするためのCliEn-seqテクノロジーを成功裏に策定し,適用しました.
- 特定のPMTの in vivo 活動を調査する能力を実証しました.
- 以降の分析のために独特に改変された染色体の識別を可能にしました.
結論:
- CliEn-seqは,生きている細胞におけるPMT調節された表遺伝的プロセスを研究するための新しく効果的な技術です.
- この技術は,個々のPMTの機能を区別する際の限界を解決します.
- CliEn-seqは,さまざまな生物学的環境におけるクロマチンのメチル化イベントの解読に広く適用できます.
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