シスプラチンとアデニン,グアニンの相互作用:IRMPD,MS/MS,理論的研究を組み合わせたIRMPD,MS/MS,理論的研究
Barbara Chiavarino1, Maria Elisa Crestoni, Simonetta Fornarini
1Dipartimento di Chimica e Tecnologie del Farmaco, Università di Roma La Sapienza, P.le A. Moro 5, I-00185 Roma, Italy. barbara.chiavarino@uniroma1.it
Journal of the American Chemical Society
|January 1, 2013
まとめ
赤外線スペクトロスコピーは,シスプラチンがN7原子でグアニンと結合し,水素結合を形成することを明らかにします. アデニン-シスプラチン複合体は,N3とN1の位置に結合した2つの主要な同位体として存在します.
科学分野:
- 協調化学は,協調化学である.
- スペクトル顕微鏡検査です.
- 計算化学はコンピュータ化学である.
背景:
- シスプラチンは重要な化学療法薬である.
- DNA塩基との相互作用を理解することは,薬の開発に不可欠です.
- 分子構造を解明する際の鍵は,光譜法と計算法である.
研究 の 目的:
- IRMPDスペクトロスコピーを用いてシスプラチンとグアニン,アデニンの結合モードを特徴づける.
- これらのプラチナ複合物の特定の固定部位と構造的形状を決定する.
- 実験的なスペクトロスコピクデータで計算モデルを検証する.
主な方法:
- 950~1900cm (-1) と2900~3700cm (-1) の領域における赤外線複数の光子解離 (IRMPD) スペクトロスコピー.
- 量子化学計算 (B3LYP/LACV3P/6-311G**) で,幾何学の最適化とIRスペクトルの予測を行う.
- 結合と相互作用を特定するために,C=Oストレッチを含む特徴的な振動周波数の分析.
主要な成果:
- cis-[Pt(NH3) 2(G) Cl]+については,IRMPDと計算により,PtがグアニンのN7原子に結合することを確認した.
- NH3リガンドとグアニンのカルボニル群との間に水素結合が特定され,赤にシフトしたC=Oが1718cmで伸びていることが証明されています.
- cis-[Pt(NH3) 2 ((A) Cl]+の場合,IRMPDのスペクトルは,アデニンのN3 (PtAN3) とN1 (PtAN1) 位置に結合するPtという2つの主要な同位体を示しています.
結論:
- シスプラチンは,NH3リガンドとグアニンのカルボニル酸素を含む重要な水素結合相互作用により,N7原子経由でグアニンと優先的に結合します.
- アデニンとの相互作用は,PtAN3とPtAN1という2つの異なった同位体をもたらし,シスプラチンとDNA塩基との複雑な結合偏好を強調しています.
