正確な塩基対と不正確な塩基対の合成の間のエネルギー差は,非常に正確なDNA複製を説明する
Andrew C Olson1, Jennifer N Patro, Milan Urban
1Department of Chemistry and Biochemistry, University of Colorado, UCB 215, Boulder, Colorado 80309, USA.
Journal of the American Chemical Society
|January 16, 2013
まとめ
DNA複製の精度は,好ましいエネルギーによって左右されます. 直接的な測定では,正しいヌクレオチド組み込みのためのエネルギー差が予想よりもはるかに大きく,複雑なポリメラーゼメカニズムなしで高精度で十分であることを示しています.
科学分野:
- 分子生物学は分子生物学である.
- バイオケミストリー バイオケミストリー
- 遺伝学 遺伝学とは
背景:
- 正確なDNA複製は,遺伝子の安定性にとって極めて重要です.
- 以前の核酸組み込みエネルギーの推定値は間接的であった.
- DNAフィデリティのエネルギー基盤を理解することは,ポリメラーゼの機能を理解する鍵です.
研究 の 目的:
- 二重鎖DNA (dsDNA) に核酸を組み込むための自由エネルギー変化 (ΔG(o)) を直接測定する.
- 正確な塩基対合成と誤った塩基対合成の間のエネルギー差を定量化するために.
- これらのエネルギーがDNA複製の全般的な信頼性に与える貢献を評価する.
主な方法:
- 溶液中の ΔG の直接測定.
- 正確な対不正なヌクレオチドの組み込みのためのエネルギーの比較.
- DNAポリメラーゼの忠実性に対するエネルギー貢献の分析.
主要な成果:
- 正確な塩基対合成と誤った塩基対合成の間の測定されたエネルギー差 (ΔΔG) は,これまで考えられていたよりも大幅に大きかった (平均5.2 ± 1.34 kcal mol-1).
- これらのエネルギーだけでは,DNA複製の高い精度を説明するのに十分です.
- 初期のポリメラーゼは,正確な核酸ポリメリゼーションのための固有の熱力学的好意性に依存していたのかもしれない.
結論:
- 正確なヌクレオチド結合の固有の熱力学的好みは,DNA複製の精度の主要な原動力である.
- 洗練された校正メカニズムは,初期のポリメラーゼには必要ではなかったかもしれない.
- これらの発見は,高精度DNAおよびRNA複製を理解するための熱力学的基礎を提供します.
さらに関連する動画
関連する概念動画
Proofreading
Synthesis of new DNA molecules is carried out by the enzyme DNA polymerase, which adds nucleotides on the daughter strand complementary to the template DNA strand. DNA polymerase has a higher affinity to add the correct base and ensures fidelity during DNA replication. Furthermore, it exhibits proofreading activity during replication, using an exonuclease domain that cuts off incorrect nucleotides from the nascent DNA strand.
Errors During Replication are Corrected by the DNA Polymerase Enzyme
Errors During Replication are Corrected by the DNA Polymerase Enzyme
Proofreading
Overview
Improving Translational Accuracy
Base complementarity between the three base pairs of mRNA codon and the tRNA anticodon is not a failsafe mechanism. Inaccuracies can range from a single mismatch to no correct base pairing at all. The free energy difference between the correct and nearly correct base pairs can be as small as 3 kcal/ mol. With complementarity being the only proofreading step, the estimated error frequency would be one wrong amino acid in every 100 amino acids incorporated. However, error frequencies observed in...
Mismatch Repair
Organisms are capable of detecting and fixing nucleotide mismatches that occur during DNA replication. This sophisticated process requires identifying the new strand and replacing the erroneous bases with correct nucleotides. Mismatch repair is coordinated by many proteins in both prokaryotes and eukaryotes.
The Mutator Protein Family Plays a Key Role in DNA Mismatch Repair
The human genome has more than 3 billion base pairs of DNA per cell. Prior to cell division, that vast amount of genetic...
The Mutator Protein Family Plays a Key Role in DNA Mismatch Repair
The human genome has more than 3 billion base pairs of DNA per cell. Prior to cell division, that vast amount of genetic...
Mismatch Repair
Overview
Mismatch Repair
Overview


