hnRNP CとU2AF65の間の直接的な競争は,Alu元素のエクソニゼーションからトランスクリプトームを保護します

科学分野:

• ゲノミクスゲノミクスとは
• 分子生物学は分子生物学である.
• RNA スプライシング

背景:

• 人間のゲノムは,転写された領域内に約65万個のAlu元素を含んでいます.
• Alu元素は,暗号的なスプライスサイトを有しており,成熟したトランスクリプトに異常な含有のリスクをもたらし,トランスクリプトームの完全性を脅かします.
• Alu元素のエクソニゼーションを防ぐ分子メカニズムは,ほとんど不明のままである.

研究 の 目的:

• 転置可能な要素の異常なエクソニゼーションから人間のトランスクリプトームが保護されるメカニズムを解明する.
• Alu元素の含有を防止するRNA結合タンパク質 hnRNP Cの役割を調査する.

主な方法:

• 定量的なiCLIP (個別核酸分解性クロスリンクング免疫プレシピテーション) で,RNA結合タンパク質の相互作用をマッピングする.
• ミニジェネは,スプライシングイベントと突然変異の影響を研究するためにアッセイを行います.
• 本物および暗号的なスプライスサイトでの hnRNP CおよびU2AF65結合の分析.

主要な成果:

• hnRNP Cは,Alu要素内のスプライスサイトを含む多数のスプライスサイトでスプライス因子U2AF65と競合する.
• hnRNP C機能の喪失は,以前に抑制されたAluエクソンが形成され,トランスクリプト機能の重要な障害につながります.
• Alu要素内の病気に関連した変異は,hNNP C結合を損なうことが判明し,その有害な効果を説明しました.

結論:

• hnRNP Cは,U2AF65がAlu元素と結合することを防止し,トランスクリプトームの完全性を保護することによって,全ゲノムのセンチネルとして作用します.
• このメカニズムは,移植可能な要素の破壊的な影響からヒトのトランスクリプトームを保護するために不可欠です.
• この発見は,人間の進化と,アルウ元素に関連した病気の遺伝的根拠を理解する上で重要な意味を持つ.