プロモーターの方向性は,U1のsnRNPとポリアデニレーション信号によって制御されます

科学分野:

• ゲノミクスゲノミクスとは
• 分子生物学は分子生物学である.
• 遺伝子規制 遺伝子規制

背景:

• 哺乳類のゲノム転写は普遍的だが,生産的な転写は未知のメカニズムによって制限されている.
• RNAポリメラーゼII (RNAPII) は,ほとんどのプロモーターとは異なる方法で発動しますが,長さは主に感覚コーディング方向に発生します.

研究 の 目的:

• プロモーターの指向性と生産的な転写を制御するメカニズムを調査する.
• プロモーター近接分裂とポリアデニレーションを調節する配列決定因子を特定する.

主な方法:

• マウスの胚性幹細胞の分析.
• トランスクリプション開始部位の横に並ぶ配列決定因子の新たなモチーフ分析.
• U1小核リボヌクレオプロテイン (snRNP) の活性に対する機能的障害.

主要な成果:

• 非対称な配列決定因子は,プロモーター-近接割れとポリアデニレーションを通じてプロモーターの方向性を調節する.
• アップストリームアンチセンセスのRNAは,開始直後に分裂され,ポリアデニル化されます.
• U1のsnRNP認識サイトとPASの信号は,感覚と反感覚の方向に差異的に分布し,時間とともに進化する.
• U1 snRNPの活性に障害が生じると,プロモーター-近接割れ事件が増加する.

結論:

• U1-PAS軸は,上流アンチセンセスの転写の早期終了を促進することによって,プロモーターの方向性を強化します.
• この軸は,U1 snRNP経由で近接感PAS信号を抑制することによって,全ゲノムにわたる広範囲の転写を制限します.
• この発見は,ゲノム全体の転写を制御するための新しい規制メカニズムを明らかにしています.