構造化されたD-RNA分子の結合は,L-RNAアプタマーによって行われます

科学分野:

• * 分子生物学 * 分子生物学
• * 核酸化学について
• * ウイルス学 ウイルス学

背景:

• *HIV-1は,複製のためにトランス活性化反応性 (TAR) RNA要素に依存しています.
• * Tat-TARの相互作用は,TAR RNAの機能とウイルスの複製に不可欠です.
• * アプタマーとは,核酸の短い配列で,高い親和性と特異性で標的を結合するものです.

研究 の 目的:

• *HIV-1 TAR RNAの天然のD型を結合できるL-RNAアプタマーを開発する.
• * L-アプタメルの結合モードとD-TAR RNAとの親和性を調査する.
• * 構造RNAに対する治療薬としてのL-アプタマーの可能性を評価する.

主な方法:

• *L-TAR RNAに対するD-アプタマーを得るために,インビトロ選択を用いた.
• * 化学合成により,対応するL-アプタマーが作られました.
• *結合親和度 (Kd) と相互作用部位は,生体物理学的方法を使用して決定されました.
• *タット-TAR複合体の形成の抑制が評価されました.

主要な成果:

• * 100 nMの解離定数 (Kd) でD-TAR RNAを結合するL-アプタマーが合成されました.
• *L-アプタメルは,D-TAR RNAの6核酸ディスタルループにのみ結合する.
• *結合はワトソン・クリック配列ではなく,三次相互作用によって発生し,対極キラリティの核酸間の新しい結合モードを表します.
• *L-アプタマー結合は,必須のTat-TARリボ核タンパク質複合体の形成を阻害する.

結論:

• *この研究は,L-およびD-核酸の間の特定の三次相互作用の最初の例を示しています.
• * D-TAR RNAを標的にするL-アプタマーは,HIV-1複製の重要なステップを阻害することができます.
• * L-アプタマーはリボヌクレアースに耐性があるため,抗意味オリゴヌクレオチドに対する有望な代替手段として,構造RNAを治療的に標的とする.