酵素RNA合成の普遍的なアプタマーベースのリアルタイムモニタリング
Katharina Höfer1, Lisa V Langejürgen, Andres Jäschke
1Institute of Pharmacy and Molecular Biotechnology, Heidelberg University , 69120 Heidelberg, Germany.
Journal of the American Chemical Society
|September 3, 2013
まとめ
この研究では,実験室内転写中のRNA合成をリアルタイムでモニタリングするためのユニバーサル光モジュール (UFM) が導入されています. この新しいシステムは,合成されたRNAの正確な定量化と品質評価を可能にします.
科学分野:
- 分子生物学は分子生物学である.
- バイオケミストリー バイオケミストリー
- 合成生物学 合成生物学とは
背景:
- インビトロ転写は,酵素によるRNA合成に不可欠である.
- 現在の方法では,転写中のRNAの質と量のリアルタイム分析が欠けている.
- 中絶性転写副産物は,正確なモニタリングを複雑にします.
研究 の 目的:
- 任意のRNA合成のリアルタイムモニタリングと定量化のための普遍的なシステムを開発する.
- 副産物による干渉を回避することによって,既存の方法の限界を克服する.
- RNA合成の標準化と高通量スクリーニングを可能にする.
主な方法:
- スパイナッチアプタマーとハンマーヘッドリボ酵素からなるユニバーサル光モジュール (UFM) が設計されました.
- UFMは,興味のあるRNA (ROI) に付加されました.
- 主要トランスクリプトの割れは,DFHBI染料を結合して光を生成するUFMを放出します.
主要な成果:
- このシステムは,RNA配列,ポリメラーゼ,またはプロモーターに関係なく,RNA合成のリアルタイム定量化を提供します.
- UFMは,中断した転写製品の干渉なしにモニタリングを可能にします.
- 標準化,並列化,および高通量スクリーニングのための実証された可能性.
結論:
- 開発された普遍的な光モジュールは,in vitro RNA合成のリアルタイム分析のための堅牢で汎用的なソリューションを提供します.
- この方法は,RNA生産の質と量を評価する能力を大幅に向上させます.
- RNA合成アプリケーションにおける効率的な最適化とスクリーニングを容易にする.
関連する概念動画
Real Time RT-PCR
Real-time reverse transcription-polymerase chain reaction, or Real-time RT-PCR, is an analytical tool used to determine the expression level of target genes. The method involves converting mRNA to complementary DNA with the help of an enzyme known as reverse transcriptase, followed by the PCR amplification of the cDNA. These two processes can be performed simultaneously in a single tube or separately as a two-step reaction.
The real-time quantification of the number of amplified products is...
The real-time quantification of the number of amplified products is...
Ribosome Profiling
Ribosome profiling or ribo-sequencing is a deep sequencing technique that produces a snapshot of active translation in a cell. It selectively sequences the mRNAs protected by ribosomes to get an insight into a cell’s translation landscape at any given point in time.
Applications of ribosome profiling
Ribosome profiling has many applications, including in vivo monitoring of translation inside a particular organ or tissue type and quantifying new protein synthesis levels.
The technique helps...
Applications of ribosome profiling
Ribosome profiling has many applications, including in vivo monitoring of translation inside a particular organ or tissue type and quantifying new protein synthesis levels.
The technique helps...


