アップストリーム配列は,ヒト7SLRNA遺伝子の内部プロモーターを調節する

科学分野:

• ゲノミクスゲノミクスとは
• 分子生物学は分子生物学である.
• RNA 生物学 RNA 生物学

背景:

• 人間のゲノムには7SL RNAに関連する多数の配列が含まれており,その中には7SL遺伝子,偽遺伝子,そして豊富なAlu配列が含まれています.
• 7SL遺伝子とAlu要素はRNAポリメラーゼIIIによって転写されるが,発現レベルは大きく異なる.

研究 の 目的:

• RNAポリメラーゼIIIによる7SL遺伝子とAlu元素の異なった転写効率の背後にある理由を調査する.
• 7SL遺伝子の効率的な転写に責任を負う規制要素を特定する.

主な方法:

• ヒトの7SL遺伝子,合成アルウ配列,代表的なアルウ元素,および7SL擬似遺伝子を用いたインビトロ転写アッセイ.
• 7SL遺伝子の5'削除および挿入変異体の構築と試験を行い,重要な規制領域を特定します.

主要な成果:

• 人間の7SL遺伝子と合成アルウ誘導体は,アルウ元素や7SL偽遺伝子よりも50~100倍効率的にインビトロで発現した.
• トランスクリプション開始部位の上流の最初の37の核酸は,内部プロモーターとともに,7SL遺伝子の効率的かつ正確なトランスクリプション開始に不可欠です.

結論:

• ほとんどのAlu要素と7SL擬似遺伝子の限られた転写は, 7SL遺伝子の上流の重要な規制要素が存在しないことによる可能性が高い.
• この規制要素は,哺乳類のゲノム内のAluファミリーの均質性と,種特有の差異に寄与する可能性があります.