アンチフレームシフトリガンドは,SARSウイルスの形状の可塑性を低下させます
Dustin B Ritchie1, Jingchyuan Soong, William K A Sikkema
1Department of Physics, University of Alberta , Edmonton, Alberta T6G 2E1, Canada.
Journal of the American Chemical Society
|January 23, 2014
まとめ
アンチフレームシフトリガンドはSARSの擬似ノートコンフォーメーションの可塑性を阻害し,代替コンフォーマー形成を防止しました. この発見は,シドオノットダイナミクスをプログラムされたリボソームフレームシフトと関連付け,新しい抗ウイルス薬の標的を示唆しています.
科学分野:
- 分子生物学は分子生物学である.
- ウイルス学 ウイルス学 ウイルス学
- バイオフィジックス 生物物理学
背景:
- プログラムされた-1リボソームフレームシフト (-1PRF) は,ウイルスの遺伝子発現に不可欠です.
- mRNAの擬似結節は1PRFを刺激し,潜在的な抗ウイルス標的となる.
- 擬似結節誘発型-1PRFの正確なメカニズムについては議論されており,モデルでは形状性可塑性に焦点を当てている.
研究 の 目的:
- リガンド結合型擬似結節における構成性可塑性の役割を調査する.
- 反フレームシフトリガンドが擬似結びのダイナミクスと -1 PRF効率に影響するかどうかを判断する.
- 抗ウイルス薬の設計のためのシドオノットコンフォーメーションダイナミクスをターゲットにする可能性を探求する.
主な方法:
- 単一分子力スペクトロスコピーを利用して,SARS-CoVの擬似結節を機械的に展開しました.
- 確立された反フレームシフトリガンドがシドオノット形状動態に及ぼす影響を測定した.
- リガンド誘発による形状性可塑性の変化と -1 PRF効率の間の相関を評価した.
主要な成果:
- SARS pseudoknotへのリガンド結合は,その形状的可塑性を著しく減少させました.
- 交代的な擬似結びのコンフォーマーの形成は,リガンド結合時に廃止された.
- このコンフォメーションダイナミクスの阻害は,1のPRF効率の低下と相関していた.
結論:
- 擬似ノット形状の可塑性と -1 PRF効率の間の関連性を確認しました.
- 反フレームシフトリガンドが擬似結びのダイナミクスを破壊することを示した.
- pseudoknotのコンフォメーションダイナミクスをターゲットにすることが有効な抗ウイルス薬剤戦略であることを示唆しています.
