ADP-リボシルトランスフェラーゼの基板特異性を設計して,直接のタンパク質標的を特定します
Ian Carter-O'Connell1, Haihong Jin, Rory K Morgan
1Program in Chemical Biology and Department of Physiology and Pharmacology, and †Department of Biochemistry, Oregon Health & Science University , Portland, Oregon 97210, United States.
Journal of the American Chemical Society
|March 20, 2014
まとめ
研究者は,直接のタンパク質標的を特定するために,設計されたアデノシン二酸化リン酸リボシルトランスファーゼ (ARTDs) を開発しました. この新しい方法は,42のARTD1および301のARTD2標的を成功裏に特定し,細胞応答の研究を進めました.
科学分野:
- バイオケミストリーと分子生物学
- 酵素学 酵素学とは
- セルラー・シグナリング
背景:
- アデノシン二酸化リン酸リボシルトランスファーゼ (ARTD) は,細胞機能と疾患に不可欠です.
- 個々のARTDの特定のタンパク質標的を特定することは,機能的な冗長性のために困難です.
- 既存の方法は,17人のARTDファミリーメンバーの間で標的を区別するのに苦労しています.
研究 の 目的:
- ARTDファミリーの個々のメンバーの直接タンパク質ターゲットを特定するための新しい方法を開発する.
- 機能的な冗長性とARTD間の重複する特異性の課題を克服する.
- ARTD媒介細胞応答の詳細な研究を可能にするために.
主な方法:
- オートゴーナルなNAD (((+)) アナログエンジニアリングによるARTDペアの合理的な設計.
- エンジニアリングされたARTDs (ARTD1, -2, -6) で利用される正交NAD (((+)) 変数の合成.
- アフィニティ浄化とタンデム質量スペクトロメトリを組み合わせて,タンパク質標的を特定します.
主要な成果:
- エンジニアリングされたARTDは,正交NAD (((+)) 変数を選択的に利用しました.
- ARTD1 (PARP1) とARTD2 (PARP2) の比較により,異なるが重複するターゲットプロファイルが明らかになりました.
- 核抽出物における42の直接ARTD1標的と301の直接ARTD2標的を特定した.
結論:
- 開発された正交NAD (((+) アナログエンジニアリングによるARTDペアは,強力な新しい技術を提供します.
- この方法は,個々のARTDの直接タンパク質標的の特定を容易にする.
- ARTD経路の活性化と細胞上の結果のより深い理解を可能にします.
