マススペクトロメトリーに基づくヒトプロテオームの草案
Mathias Wilhelm1, Judith Schlegl2, Hannes Hahne3
11] Chair of Proteomics and Bioanalytics, Technische Universität München, Emil-Erlenmeyer Forum 5, 85354 Freising, Germany [2] SAP AG, Dietmar-Hopp-Allee 16, 69190 Walldorf, Germany [3].
Nature
|May 30, 2014
まとめ
本研究では,質量スペクトロメトリーベースのヒトプロテオームの草稿と,大規模なプロテオミックデータセットを分析するためのデータベースであるProteomicsDBを紹介しています. それは,臓器特異のタンパク質,翻訳された長い遺伝子間の非コーディングRNA,および薬物感受性予測の洞察を提供します.
科学分野:
- プロテオミクスはプロテオミクスを用います.
- バイオインフォマティックス
- ゲノミクスゲノミクスとは
背景:
- プロテオームには,タンパク質の豊富さ,発現パターン,遺伝子学やトランスクリプトミクスを通してアクセスできない変更など,重要な生物学的情報が含まれています.
- 人間のプロテオームを理解することは,生物学的洞察を深め,新しい技術を開発するために不可欠です.
研究 の 目的:
- マススペクトロメトリーベースのヒトタンパク質の草稿を作成する.
- 大規模なプロテオミックデータのリアルタイム分析のための公的な高性能データベースであるProteomicsDBを開発する.
- 臓器特異のタンパク質,翻訳された長いインター遺伝子非コーディングRNA (lincRNAs),および薬物感受性に関連するタンパク質を識別する.
主な方法:
- マススペクトロメトリーベースのプロテオミクスは,人間のプロテオームの草稿を生成します.
- ProteomicsDBの開発は,テラバイトのタンパク質データを処理するためのインメモリデータベースです.
- プロテオミックデータとメッセンジャーRNA発現プロファイル,薬物感受性データとの統合.
主要な成果:
- 人間のプロテオームの包括的な草案が作成されました.
- ProteomicsDBが作成され,大規模なタンパク質データセットのリアルタイム分析が可能になりました.
- 臓器特異のタンパク質,多数の翻訳されたリンカRNA,および薬剤耐性または感受性を予測するタンパク質の識別.
- 分析により,ヒトの組織全体でタンパク質の豊富さの制御が保たれていることが明らかになった.
結論:
- ヒューマン・プロテオーム・ドラフトとプロテオミクスDBは,生物学的研究に貴重なリソースを提供します.
- これらの資源は,プロテオームのナビゲーションを容易にし,生物学的洞察を提供し,プロテオーム技術の進歩をサポートします.
- この発見は,遺伝子発現,タンパク質複合体ステキオメトリー,および薬物感受性予測によるパーソナライズド医療の理解に意味を持つ.


