異なった非コーディング転写を制限するためのクロマチンベースのメカニズム
Sebastian Marquardt1, Renan Escalante-Chong2, Nam Pho3
1Department of Biological Chemistry and Molecular Physiology, Harvard Medical School, 240 Longwood Avenue, Boston, MA 02115, USA.
Cell
|June 21, 2014
まとめ
染色体組成は,異なった転写を調節する. CAF-I複合体の変異は,ノンコーディングRNAを増加させ,H3K56アセチル化とSWI/SNFは,核細胞の周回を促すことで転写を促進する.
科学分野:
- 分子生物学は分子生物学である.
- 遺伝学 遺伝学とは
- エピジェネティクス エピジェネティクス
背景:
- ユカリオットmRNAプロモーターは,注釈されたmRNAと共に,しばしば異なった非コーディングトランスクリプトを生成します.
- 異変転写の調節を理解することは,遺伝子発現の複雑さを理解するために不可欠です.
研究 の 目的:
- 異なるプロモーターの方向性を有する重要な規制者を特定する.
- 双方向転写のバランスを制御するクロマチンの役割を調査する.
主な方法:
- ゲノム置換実験は,プロモーターの方向性を研究するために使用されました.
- 2方向の光タンパク質レポーターシステムは,転写比に影響を与える突然変異体をスクリーニングするために酵母に使用されました.
- クロマチンの組立因子とヒストンの改変の分析.
主要な成果:
- クロマチンアセンブリは,異なった転写の重要なレギュレータとして特定されました.
- CAF-I複合体の変異は,新生多様性非コーディングトランスクリプトの全ゲノムにわたる減圧につながった.
- H3K56のハイパーアセチル化とSWI/SNFリモデレータは,強化された核粒子の周回を通じて,CAF-Iの役割に反して,異なった転写を促進しました.
結論:
- クロマチン媒介メカニズムは,異なった転写開始を著しく影響する.
- これらの発見は,非コーディングRNAの終結と分解を調節する既知の下流経路を補完しています.
- この研究は,染色体ダイナミクスと双方向遺伝子発現の調節の相互作用を強調しています.
関連する概念動画
Chromatin Structure Regulates pre-mRNA Processing
6.6K
In eukaryotic cells, nascent mRNA transcripts need to undergo many post-transcriptional modifications to reach the cell cytoplasm and translate into functional proteins. For a long time, transcription and pre-mRNA processing were considered two independent events that occur sequentially in the cell. However, it has now been well established that transcription and pre-mRNA processing are two simultaneous processes that are precisely regulated inside the cell.
The chromatin structure, especially...
The chromatin structure, especially...
6.6K
Cis-regulatory Sequences
9.4K
Cis-regulatory sequences are short fragments of non-coding DNA that are present on the same chromosomes as the genes that they regulate. These fragments serve as binding sites for transcriptional regulators, proteins that are responsible for controlling gene transcription and differential gene expression across cell types in eukaryotes. Cis-regulatory sequences can be close to the gene of interest or thousands of bases away in the DNA sequence; however, those sequences that are further away are...
9.4K
Cis-regulatory Sequences
3.0K
3.0K
Cooperative Binding of Transcription Regulators
6.0K
Transcriptional regulators bind to specific cis-regulatory sequences in the DNA to regulate gene transcription. These cis-regulatory sequences are very short, usually less than ten nucleotide pairs in length. The short length means that there is a high probability of the exact same sequence randomly occurring throughout the genome. Since regulators can also bind to groups of similar sequences, this further increases the chances of random binding. Transcriptional regulators form...
6.0K
Cooperative Binding of Transcription Regulators
1.8K
1.8K
Heterochromatin
12.0K
The extent of chromatin compaction can be studied by staining chromatin using specific DNA binding dyes. Under the microscope, the dense-compacted regions that take up more dye are called heterochromatin. Heterochromatin is further classified into two forms – constitutive heterochromatin and facultative heterochromatin.
Constitutive heterochromatin: It is a highly compact region of chromatin that is mostly concentrated in the centromere and telomere. Unlike euchromatin, the amino acid at...
Constitutive heterochromatin: It is a highly compact region of chromatin that is mostly concentrated in the centromere and telomere. Unlike euchromatin, the amino acid at...
12.0K


