"ミニマリスト"サイクロプロペンを含有するフォトクロスリンク機は,生細胞画像と親和性ベースのタンパク質ラベリングに適しています

科学分野:

• 化学生物学 化学生物学とは
• プロテオミクス プロテオミクスは,プロテオミクスの
• ドラッグ・ディスカバリー・ドリッグ・ディスカバリー・ドリッグ・ディスカバリー・ドリッグ・ディスカバリー

背景:

• 本来の細胞環境における生物活性化合物の標的を特定することは,極めて重要ですが,従来のインビトロ方法を使用すると困難です.
• 現在の方法では,生きている細胞内の小さな分子を同時に画像化し,標的を特定する能力が欠けている.
• 既存のフォトアフィニティラベルは,多くの場合,大きな変更を必要とし,銅無しのバイオオートホーゴナル化学と互換性がない.

研究 の 目的:

• 生きた哺乳類の細胞における生物活性化合物の同時にインシット画像と標的の識別を行うための新しい化学探査機を開発する.
• 銅のないバイオオートホーゴナル化学に適したミニマリストなリンクヤーを作成し,最小限の修正された探査機を可能にします.
• プロテオームをプロファイリングし,BRD-4阻害剤 (+) -JQ1.1のオフターゲットを特定する.

主な方法:

• アルキルディアジリンとサイクロプロペンの両方を含む新しいミニマリストのリンク剤の開発.
• BD-2などの化学探査機を合成し,これらのリンク器を組み込む.
• 素早い,無銅のテトラジン-サイクロプロペンの結合を用いて,インシトゥ画像とコバルントラベリングを行う.
• 細胞ベースのプロテオームプロファイリングの実験を行う.

主要な成果:

• 新しく開発された化学探査機により,内生的なBRD-4の同時にインシット画像と共振性ラベリングが可能になった.
• 探査機は,高速で銅のないバイオオートホーゴナル反応 (テトラジン-サイクロプロペン結合) を高効率で利用した.
• プロテオームプロファイリングにより,BRD-4阻害剤 (+) -JQ1の潜在的オフターゲットが特定され,そのいくつかは検証によって確認されました.

結論:

• 開発された化学探査機は,生体細胞の生物画像と標的の識別を同時に行う強力な戦略を提供します.
• このアプローチは,以前の方法の限界を克服し,タンパク質と小分子間の相互作用を,その本来の文脈で研究することを可能にします.
• この発見は,薬物の発見と細胞メカニズムを理解するための化学プロテオミクスの戦略を前進させています.