非コーディングRNAトランスクリプションは,AIDをB細胞の異なった転写位置に標的とする
Evangelos Pefanis1, Jiguang Wang2, Gerson Rothschild3
11] Department of Microbiology and Immunology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York, New York 10032, USA [2] Regeneron Pharmaceuticals, Tarrytown, New York 10591, USA [3].
RNAエクソソーム複合体は,B細胞のノンコーディングRNA (ncRNA) を調節する. 欠乏すると,ゲノム不安定とDNA損傷が生じ,ncrnaはB細胞の健康と結びつきます.
科学分野:
- 遺伝学 遺伝学とは
- 分子生物学は分子生物学である.
- 免疫学 免疫学とは
背景:
- 哺乳類のゲノムは,ノンコーディングRNA (ncRNA) を広く表現しています.
- 3'-5'エクソリボ核分裂活性に不可欠なRNAエクソソーム複合体は,非コーディングトランスクリプトームを潜在的に支配する.
- B細胞は,抗体多様性のためにクラス・スイッチ・リコンビネーションとソマティック・ハイパーミューテーションを利用し,活性化誘発型シチジン・デアミナーゼ (AID) によって媒介されるプロセスである.
研究 の 目的:
- B細胞機能とゲノム整合性におけるRNAエクソソーム複合体の役割を調査する.
- RNAエクソソーム複合体によって調節される新しいncRNAを特定する.
- ncRNA転写とB細胞のDNA損傷および修復を結びつけるメカニズムを解明する.
主な方法:
- マウスモデルでのExosc3サブユニットの条件付きの削除により,Exosc3欠乏B細胞が生成されます.
- 新しいncRNA基板を特定するために,Exosc3欠乏性B細胞のトランスクリプトーム分析.
- ncRNA発現に関連したDNA変異と転位パターンの分析.
主要な成果:
- エクソスク3欠乏性B細胞は,クラス・スイッチ再結合と体性高変異の障害を示します.
- xTSS-RNAを含む新しいRNAエクソソーム基板ncRNAが特定されました.
- xTSS-RNAsは,トランスクリプション開始部位に関連したアンチセンセスのトランスクリプトであり,特にAID媒介による変異または転位を経験している遺伝子で.
- トランスロケーションとDNA二重鎖の断裂は,ncRNA発現の領域で起こります.
結論:
- RNAエクソソーム複合体は,B細胞のゲノム整合性に関与するxTSS-RNAなどのncRNAを調節する.
- RNAのエクソソーム調節によるncRNAトランスクリプションは,特定のゲノム部位にAIDを勧誘し,単一鎖DNAおよびRNA-DNAハイブリッドを促進します.
- RNAエクソソーム複合体によるncRNAの調節障害は,B細胞のゲノム不安定化に寄与する.
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