マウスのリファレンス集団におけるミトコンドリア活性の多層遺伝子およびオミックスの解剖
Yibo Wu1, Evan G Williams2, Sébastien Dubuis1
1Department of Biology, Institute of Molecular Systems Biology, Eidgenössische Technische Hochschule Zürich (ETHZ), Zurich 8093, Switzerland.
Cell
|September 13, 2014
まとめ
遺伝学と食生活は,複雑な特徴に大きく影響します. この研究では,Dhtkd1のような代謝表型の主なレギュレータを特定するために,マルチオミックスのデータを統合した.
科学分野:
- ゲノミクスとシステム生物学
- メタボロミクスとプロテオミクス
背景:
- 遺伝子型と環境の相互作用を理解することは,複雑な現象型にとって極めて重要です.
- BXDマウスの遺伝子参照集団は,そのような研究のための強力なモデルを提供します.
研究 の 目的:
- 遺伝子型と食事が分子プロファイルと代謝現象型にどのように影響するか調査する.
- 複雑な代謝の特徴の遺伝的位置と分子調節体を特定する.
主な方法:
- 量化されたトランスクリプトーム,肝臓プロテオーム,および代謝細胞を2つの食事で40のBXDマウス株で測定した.
- 標的型プロテオミクスと遺伝子マッピング (QTL分析) を利用しました.
主要な成果:
- メタボリックフェノタイプに関連した多数のトランスクリプト,タンパク質,およびメタボライトQTLを発見した.
- Dhtkd1を2アミノアジパートの重要な調節体として特定し,グルコースと糖尿病の状態に影響を与えました.
- 種間での特徴的な変数でありながら保存されたミトコンドリアの展開タンパク質応答 (UPR ((mt)) です.
結論:
- 統合されたマルチオミックスのアプローチは,複雑な代謝現象型の解剖に価値があります.
- 遺伝的および環境的要因は,代謝の健康に重要な役割を果たします.
- Dhtkd1とUPR (mt) は,代謝調節を理解するための重要な標的である.
