希少なメンデルの疾患の遺伝子識別のための臨床エクソームシーケンシング
Hane Lee1, Joshua L Deignan1, Naghmeh Dorrani2
1Department of Pathology and Laboratory Medicine, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles2Clinical Genomics Center, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles.
トリオ臨床エクソームシーケンシング (Trio clinical exome sequencing, CES) は,サンバンドのみのCESと比較して,まれな遺伝疾患の診断成果を大幅に改善します. このアプローチは,未診断の患者におけるデノボと複合性ヘテロジゴト変異の識別に極めて重要です.
科学分野:
- ゲノミクスゲノミクスとは
- 分子診断は分子診断です.
- 希少遺伝疾患 希少遺伝疾患とは
背景:
- 臨床エクソームシーケンシング (CES) は,まれな遺伝疾患の診断にますます利用されています.
- 診断されていない疾患の遺伝的根拠を特定することは,臨床実務における課題であり続けています.
研究 の 目的:
- CESの紹介のための臨床的徴候を評価するために.
- 異なるCESテストタイプとフェノタイプのサブグループに対する分子診断率を決定する.
- トリオ-CESとプロバンド-CESの診断収率を比較する.
主な方法:
- 遺伝疾患の疑いのある814人の患者が2012年から2014年の間にCESを受けた.
- CESはtrio-CES (親と子) またはproband-CES (個人のみ) として実行されました.
- 診断率は全体的に,表型別,検査タイプ別で分析されました.
主要な成果:
- 全体的な分子診断率は26%でした.
- Trio-CESは31%の診断率を達成し,proband-CES (22%) よりも大幅に高かった.
- 5歳未満の発達遅延の子どもでは,トリオ-CESは41%,プロバンド-CESは9%の診断率をもたらしました.
結論:
- Trio-CESは,疑わしい遺伝的条件に対するプロバンド-CESよりも高い分子診断率を示しています.
- トリオ-CESの生産性の向上は,デノボと複合性ヘテロジゴス変種の検出に起因する.
- これらの発見を検証し,臨床的および経済的結果を評価するために,さらなる研究が必要である.
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