KINATEST-ID:リン酸化依存型テリビウム感受性キナーゼアッセイの開発のためのパイプライン
Andrew M Lipchik1, Minervo Perez, Scott Bolton
1Department of Medicinal Chemistry and Molecular Pharmacology, College of Pharmacy, Center for Cancer Research, Purdue University , West Lafayette, Indiana 47907.
Journal of the American Chemical Society
|February 18, 2015
まとめ
非受容体タンパク質チロシンキナーゼ (NRTKs) のための新しいペプチド基板の開発は困難です. この研究は,急速なキナーゼスクリーニングのための特定のランタニド感受性基板を設計するためのin silicoパイプラインを提示します.
科学分野:
- バイオケミストリー バイオケミストリー
- 分子生物学は分子生物学である.
- ドラッグ・ディスカバリー・ディスカバリー・ドラッグ・ディスカバリー・ドラッグ・ディスカバリー
背景:
- 非受容体タンパク質チロシンキナーゼ (NRTK) は,細胞機能にとって極めて重要であり,薬剤開発における重要な標的である.
- ランタニドベースのキナーゼアッセイのための特定のペプチド基板の設計は,NRTK間の構造的類似性と,メタルイオン結合と配列選択性を統合する課題のために困難です.
研究 の 目的:
- リン酸化依存性,ランタニド感受性ペプチド基板の設計のための一般化可能なin silicoパイプラインを開発する.
- 高通量スクリーニング (HTS) アプリケーションに適したキナーゼ固有の基板を作成します.
主な方法:
- 固有のキナーゼ基板および既知のテリウム (Tb(3+)) 結合配列からのキュレーティングされたプロテオミックデータを使用した.
- 潜在的なペプチド基板の生成,スクリーニング,アラインニング,選択のための計算ツールを開発しました.
- Tb(3+) 感受性のための金属イオン結合特性を持つ統合された配列選択性.
主要な成果:
- キナーゼファミリー内で選択性を示すいくつかのペプチド基板を成功裏に設計しました.
- 高通量スクリーニング (HTS) アプリケーションで開発された基板の有用性を実証しました.
- in silicoパイプラインの効率的かつ特定のキナーゼアッセイを生成する能力を検証しました.
結論:
- 開発されたin silicoパイプラインは,実質的に任意のチロシンキナーゼのための特定のランタニドベースのアッセイを作成するための戦略を提供します.
- パイプラインとそのツールは,他の酵素測定またはタンパク質結合リガンドの識別に適応することができます.
- このアプローチは,キナーゼの活性性の迅速かつ敏感なスクリーニングを容易にし,薬剤発見の努力を助けます.
