pH依存細胞ラベリングのための"スマート"128Xe NMRバイオセンサ
Brittany A Riggle1, Yanfei Wang1, Ivan J Dmochowski1
1Department of Chemistry, University of Pennsylvania, 231 South 34th Street, Philadelphia, Pennsylvania 19104-6323, United States.
Journal of the American Chemical Society
|April 8, 2015
まとめ
私たちはペプチド-クリプトファンの複合体を用いてスマートなクセノン-129 NMRバイオセンサを開発しました. このバイオセンサは,その構造を変えることで酸性環境を検出し,潜在的な癌診断のためのpH依存の細胞ラベリングを可能にします.
科学分野:
- 生物物理化学 生物物理化学
- 化学生物学 化学生物学とは
- 核磁共振 (NMR) スペクトロスコピー
背景:
- ペプチドの形状の変化は,生物学的機能にとって極めて重要です.
- 酸性環境に対して敏感な探査機を開発することは,生物学的および医学的な応用にとって重要です.
- クセノン-129 NMRは,分子画像とセンシングのためのユニークな特性を提供しています.
研究 の 目的:
- "スマート"のクセノン-129 NMRバイオセンサを作成するために.
- pHに依存する細胞のラベリングのためにペプチドの構成変化を活用する.
- 酸性環境におけるこのバイオセンサの応用と,がんの診断を調査する.
主な方法:
- 30merのEALA-リピートペプチドをクリプトファンの宿主分子に結合する.
- pHに依存するペプチド構成の特徴 (pH5.5ではα-ヘリックス,pH7.5では無秩序).
- クセノン-129 NMRの化学シフトと超極化化学交換飽和移転 (ハイパー-CEST) NMRの測定.
主要な成果:
- クセノン-129 NMRの化学的シフトは,強いpH依存性 (Δδ = 3.4 ppm) を示した.
- ペプチドクリプトファンの検出限界は10~11Mまで低かったが,他のNMR pH レポーターよりも著しく低かった.
- pH 5.5でのペプチド細胞膜挿入は,暗号ファン- 129) Xe NMR信号の 13.4 ppm の下方フィールドシフトを誘導しました.
結論:
- 開発されたクセノン-129 NMRバイオセンサは,ペプチド構成の移行を通じてpHの変化を効果的に検出します.
- この技術は,ペプチドの構造と機能の超敏感な探査を可能にします.
- 潜在的な応用には,がんの診断と治療のモニタリングのためのpH依存の細胞ラベリングが含まれます.
関連する概念動画
Labeling DNA Probes
9.6K
DNA probes are fragments of DNA labeled with a reporter tag to enable their detection or purification. The resulting labeled DNA probes can then hybridize to target nucleic acid sequences through complementary base-pairing, and may be used to recover or identify these regions.
Radioisotopes, fluorophores, or small molecule binding partners like biotin or digoxigenin, are the most widely used reporter tags for labeling DNA probes. These labels can be attached to the probe DNA molecule via...
Radioisotopes, fluorophores, or small molecule binding partners like biotin or digoxigenin, are the most widely used reporter tags for labeling DNA probes. These labels can be attached to the probe DNA molecule via...
9.6K
Protein Dynamics in Living Cells
2.8K
Different fluorescence-based techniques are used to study the protein dynamics in living cells. These techniques include FRAP, FRET, and PET.
Fluorescent recovery after photobleaching (FRAP) is a fluorescent-protein-based detection technique used to quantify protein movement rates within the cell. This method exposes a small portion of the cell to an intense laser beam. The laser beam causes permanent photobleaching of the fluorophore-tagged proteins in the exposed region. As the bleached...
Fluorescent recovery after photobleaching (FRAP) is a fluorescent-protein-based detection technique used to quantify protein movement rates within the cell. This method exposes a small portion of the cell to an intense laser beam. The laser beam causes permanent photobleaching of the fluorophore-tagged proteins in the exposed region. As the bleached...
2.8K


