Xist lncRNAは,SHARPと直接相互作用して,HDAC3を通じた転写を沈黙させます
Colleen A McHugh1, Chun-Kan Chen1, Amy Chow1
1Division of Biology and Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, California 91125, USA.
研究者は,X染色体不活性化を理解するために,Xist長い非コーディングRNA (lncRNA) と相互作用するタンパク質を特定しました. SHARP,SMRT,HDAC3は,Xist媒介の遺伝子サイレンシングとポリコンブ抑制複合体2の募集に不可欠です.
科学分野:
- エピジェネティクス エピジェネティクス
- 分子生物学は分子生物学である.
- 遺伝学 遺伝学とは
背景:
- 長い非コーディングRNA (lncRNAs) は,多様なメカニズムを通じて遺伝子発現を調節する.
- Xist lncRNAは雌性哺乳類のX染色体不活性化を誘発するが,そのタンパク質相互作用因子はほとんど不明である.
- 現在の方法では,lncRNAsと直接相互作用するタンパク質を包括的に特定するには不十分です.
研究 の 目的:
- lncRNAを浄化し,直接相互作用するタンパク質を特定する方法を開発する.
- Xistのタンパク質相互作用ネットワークとそのトランスクリプションサイレンシングにおける役割を解明する.
主な方法:
- lncRNAの浄化技術の開発.
- 定量質量スペクトロメトリーは,Xist.と相互作用するタンパク質を特定するために使用されます.
- Xist-mediated silencingにおける特定されたタンパク質の役割を決定する機能的分析.
主要な成果:
- 10種類のタンパク質がXist.と特異的に関連していることが判明しました.
- SHARP,SAF-A,およびLBRは,Xist媒介の転写サイレンシングに不可欠であることが判明しました.
- SHARP,SMRT,およびHDAC3は,RNAポリメラーゼIIの排除およびポリコンブ抑制複合体2の非活性X染色体への徴募のために必要です.
結論:
- Xistは,SHARPと直接相互作用し,SMRTを勧誘し,HDAC3.3を活性化することによって,転写を沈黙させます.
- HDAC3によるヒストンの脱酸化は,RNAポリメラーゼIIを除外し,X染色体の不活性化を確立するために重要である.
- 特定されたタンパク質は,Xist機能の分子メカニズムに関する重要な洞察を提供します.
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12:42Quick Fluorescent In Situ Hybridization Protocol for Xist RNA Combined with Immunofluorescence of Histone Modification in X-chromosome Inactivation
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