関連する実験動画
Updated: Apr 12, 2026
07:27
Transcriptome Analysis of Single Cells
Published on: April 25, 2011
30.8K
ヒューマンゲノミクス ヒトゲノミクス 人間のトランスクリプトームは,組織や個体全体にまたがる.
Marta Melé1, Pedro G Ferreira2, Ferran Reverter3
1Center for Genomic Regulation (CRG), Barcelona, Catalonia, Spain. Harvard Department of stem cell and regenerative biology, Harvard University, Cambridge, MA, USA.
Science (New York, N.Y.)
|May 9, 2015
まとめ
組織や個体におけるトランスクリプトームの多様性は,安定したトランスクリプションシグネチャを明らかにする. 主要な転写が細胞特異性を駆動する一方で,スプライシングは個々のフェノタイプ,特に脳において重要な役割を果たします.
科学分野:
- ゲノミクスゲノミクスとは
- 分子生物学は分子生物学である.
- バイオインフォマティックス
背景:
- 転写および転写後の処理を含む遺伝子発現の調節は,細胞および生物の特徴に影響を与えます.
- トランスクリプトームの多様性を理解することは,生物学的複雑性と疾患関連性の解読に不可欠です.
研究 の 目的:
- RNAシーケンシングデータを用いて,ヒト組織および個体におけるトランスクリプトームの変異パターンを調査する.
- 細胞特異性の主要な原動力および現象型変異におけるスプライシングの役割を特定する.
主な方法:
- 遺伝子型組織表現 (GTEx) プロジェクトからのRNAシーケンシングデータを活用した.
- 様々なヒト組織や個体におけるトランスクリプションサインとスプライシングパターンを分析した.
主要な成果:
- 組織は,死後のサンプルでも,明確な,安定した転写サインを示します.
- 主要転写は細胞特異性の主要な決定因子であり,スプライシングは脳を除いて二次的な役割を果たします.
- 高い個体間発現変異を持つ遺伝子は,性別,民族,年齢に関連する疾患候補と関連しています.
結論:
- トランスクリプトームの変異は組織特異であり,トランスクリプションとスプライシングの両方で影響を受けます.
- スプライシング・バリエーションは,そのストキャスティックな性質にもかかわらず,個々の現象的差異,特に脳における差異に大きく寄与する可能性があります.
さらに関連する動画
関連する概念動画
01:30General Transcription Factors
7.8K
Tissue-specific transcription factors contribute to diverse cellular functions in mammals. For example, the gene for beta globin, a major component of hemoglobin, is present in all cells of the body. However, it is only expressed in red blood cells because the transcription factors that can bind to the promoter sequences of the beta globin gene are only expressed in these cells. Tissue-specific transcription factors also ensure that mutations in these factors may impair only the function of...
7.8K
02:24Ribosome Profiling
4.3K
Ribosome profiling or ribo-sequencing is a deep sequencing technique that produces a snapshot of active translation in a cell. It selectively sequences the mRNAs protected by ribosomes to get an insight into a cell’s translation landscape at any given point in time.
Applications of ribosome profiling
Ribosome profiling has many applications, including in vivo monitoring of translation inside a particular organ or tissue type and quantifying new protein synthesis levels.
The technique...
Applications of ribosome profiling
Ribosome profiling has many applications, including in vivo monitoring of translation inside a particular organ or tissue type and quantifying new protein synthesis levels.
The technique...
4.3K
02:16Transcription Factors
84.3K
Tissue-specific transcription factors contribute to diverse cellular functions in mammals. For example, the gene for beta globin, a major component of hemoglobin, is present in all cells of the body. However, it is only expressed in red blood cells because the transcription factors that can bind to the promoter sequences of the beta globin gene are only expressed in these cells. Tissue-specific transcription factors also ensure that mutations in these factors may impair only the function of...
84.3K