海洋プランクトン. 海洋ウイルスのコミュニティのパターンと生態学的要因

Jennifer R Brum¹, J Cesar Ignacio-Espinoza², Simon Roux¹

¹Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Arizona, Tucson, AZ 85721, USA.

Science (New York, N.Y.)

|May 23, 2015

まとめ

海洋ウイルスは生態系に影響を及ぼします. この研究では,タラ海洋探検のウイルスDNA (dsDNA) と形態学を分析し,ウイルスは流れによって運ばれ,地元の環境によって形作られ,高い多様性を維持することを明らかにしました.

科学分野:

マリン・マイクロバイオロジー
ウイルス学ウイルス学ウイルス学
海洋学海洋学とは

背景:

ウイルスは海洋生態系の重要な構成要素であり,微生物の個体数,多様性,代謝,遺伝子フローに影響を与えます.
ウイルスコミュニティの構造とダイナミクスを理解することは,海洋生態系の機能を理解するために不可欠です.

研究の目的:

海上部のダブルストランデッドDNA (dsDNA) ウイルスコミュニティのパターンと構造を調査する.
ウイルスのコミュニティを形作る生物地理的パターンと環境的要因を特定する.
ペラジック海洋におけるウイルスの遺伝子配列空間の完全性を評価する.

主な方法:

定量的なdsDNAウイルス分数のメタゲノミクス (ウイルス学) とウイルスコミュニティの形態学的分析.
タラ・オーシャンズ探検隊からの43個のサンプルを分析した.
ウイルスパンとコア遺伝子セットを定義するためのタンパク質クラスターカタログ.

主要な成果:

グローバルな海洋 dsDNA ウイルス学データセットを確立しました.
ウイルスのコミュニティにおける重要な生物地理的パターンを特定した.
海流によるウイルスの集団の被動的輸送が実証されている.
宿主集団に影響を与える環境要因によるウイルスのコミュニティの局所的構造を示した.

結論:

海上部のウイルスのコミュニティは,独特の生物地理的パターンを表しています.
海洋流は,ウイルスのコミュニティの分散に役割を果たします.
環境条件と宿主コミュニティの構造は,ウイルスの多様性の主要な地元の原動力です.
発見は,海洋環境における高い局所的なウイルス多様性を維持するための種子バンク仮説を支持しています.

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