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Updated: Aug 1, 2026
07:59
Temporal Quantification of MAPK Induced Expression in Single Yeast Cells
Published on: October 4, 2013
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単細胞画像と自動分析による酵母タンパク質のダイナミクス
Yolanda T Chong1, Judice L Y Koh1, Helena Friesen1
1The Donnelly Centre, University of Toronto, Toronto, ON M5S3E1, Canada.
Cell
|June 6, 2015
まとめ
研究者は酵母におけるタンパク質の豊富さと局所をマッピングするためのシステムアプローチを開発し,刺激に対する反応としてダイナミックなプロテオームの変化を明らかにしました. この定量的なデータは,さらなる生物学的な洞察と予測を可能にします.
科学分野:
- 細胞生物学 細胞生物学
- プロテオミクス プロテオミクスは,プロテオミクスの
- システム生物学 システム生物学
背景:
- プロテオミクスは大規模な定量データを生成しますが,プロテオーム分析のためのインビオシステムアプローチは未開発です.
- タンパク質の豊富性と局所性を理解することは,細胞機能の解読に不可欠です.
研究 の 目的:
- プロテオームスケールでのタンパク質の豊富性と局所性を in vivo で評価するためのシステムアプローチを開発し,適用する.
- 酵母タンパク質の局所をマッピングし,様々な化学的および遺伝的刺激の下でその動態を調査する.
主な方法:
- 酵母GFP融合コレクションを自動遺伝学と高通量顕微鏡学と組み合わせて利用しました.
- シングル・セル・ローカライゼーション・データ分析のためのアンサンブル・バイナリー分類器を開発.
- ダイナミックなプロテオームの変化を特定するために,2000万以上の細胞を分析しました.
主要な成果:
- 16のローカライゼーションクラスで約3,000のタンパク質のローカライゼーションマップを生成しました.
- ヒドロキシウレア,ラパミシン,およびrpd3Δ変異体への反応として複数の局所間で再分布するダイナミックなタンパク質を特定しました.
- 収集された定量的な,プロテオーム全体の豊富さと局所データ.
結論:
- 開発されたパイプラインは,大規模なプロテオーム分析のための堅牢な方法 in vivo を提供しています.
- 定量データは比較研究,単細胞分析,モデリング,タンパク質の行動の予測を容易にする.
- 特定の細胞の干渉に対するタンパク質のダイナミックな反応を明らかにした.
