交差する転写ネットワークは,遺伝子制御進化を制約する
Trevor R Sorrells1, Lauren N Booth1, Brian B Tuch2
11] Department of Biochemistry &Biophysics, Department of Microbiology &Immunology, University of California, San Francisco, California 94158, USA [2] Tetrad Graduate Program, University of California, San Francisco, California 94158, USA.
エピスタシス,または遺伝子相互作用は,進化の形を作ります. イーストでは,Ste12調節体が独特のDNA結合を進化させ,進化の経路はネットワークの文脈と以前の変化に依存することを示しています.
科学分野:
- 進化生物学の進化生物学について
- システム生物学 システム生物学
- 遺伝学 遺伝学とは
背景:
- エピスタシス (非添加的遺伝子相互作用) は,進化の軌道を著しく制限する.
- 転写回路のような生物学的ネットワークの進化に対するエピスタシスの影響は,未だに十分に理解されていない.
研究 の 目的:
- 交配フェロモン応答を調節する酵母転写ネットワークの進化経路を調査する.
- エピスタシスが,転写因子DNA結合モードの進化にどのように影響するかを理解する.
主な方法:
- 祖先の状態と進化的中間体の再構築.
- 転写レギュレータのSte12結合機構の分析.
- 重複する転写ネットワーク間の相互作用の検討.
主要な成果:
- 転写レギュレータSte12は,異なる酵母系にわたって2つの異なるDNA結合モードを進化させた.
- Ste12による直接的なDNA結合は,祖先の状態では利用できませんでした.
- 直接結合の進化は,細胞型特異ネットワークの先行的な系統特異変異に依存していた.
結論:
- 相互接続された生物学的ネットワーク内の位置によって,シス規制地域の進化は制約されています.
- ネットワークの文脈を理解することは,進化の経路とエピスタシスの影響を予測するために不可欠です.
さらに関連する動画
10:44Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline
Published on: December 7, 2021
10:10HOX Loci Focused CRISPR/sgRNA Library Screening Identifying Critical CTCF Boundaries
Published on: March 31, 2019
関連する概念動画
Cis-regulatory Sequences
Cis-regulatory Sequences
Cooperative Binding of Transcription Regulators
Cooperative Binding of Transcription Regulators
Regulation of Expression Occurs at Multiple Steps
Transcription results in the generation of precursor (pre-mRNA) that consists of both exons and introns, which needs further processing before being translated to a...
Regulation of Expression Occurs at Multiple Steps
