主要免疫細胞における全ゲノムCRISPRスクリーンで 制御ネットワークを解剖する
Oren Parnas1, Marko Jovanovic1, Thomas M Eisenhaure2
1Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA 02142, USA.
Cell
|July 21, 2015
まとめ
この研究では,リンパポリサッカリド (LPS) に対する腫瘍死滅因子 (Tnf) 反応を制御する遺伝子を検出するために, dendritic 細胞のCRISPRスクリーニングを使用しました. 研究者らは既知の新種のレギュレータを特定し,先天的な免疫細胞回路に関する新しい洞察を明らかにしました.
科学分野:
- 免疫学
- 細胞生物学
- 遺伝学
背景:
- 哺乳類の細胞回路を 解剖するのは難しい
- Tlr4経由のLPSによるTnf誘導のような先天的な免疫反応を理解することは,宿主の防御に極めて重要です.
研究 の 目的:
- LPSによるTnf誘導を制御する遺伝子を,全ゲノムスクリーンを用いてデンドリット細胞で特定する.
- 生まれながらの免疫経路内で新たに特定された遺伝子を機能的に分類する.
主な方法:
- ゲノム全体のCRISPR-Cas9プールライブラリスクリーニング
- タンパク質マーカーとmRNAプロファイルの測定による候補遺伝子の検証
- LPS応答に基づいてモジュールに遺伝子の機能的分類.
主要な成果:
- Tlr4シグナリングの既知および数十の新しいレギュレータを特定しました.
- 候補遺伝子を検証し 3つの機能モジュールに分類しました
- PAFとオリゴサカリルトランスフェラーゼ (OST) 複合体のLPS反応における役割が強調された.
結論:
- 生まれつきの免疫回路の 新しい構成要素と機能を発見しました
- 哺乳類の細胞回路の解剖に 遺伝的アプローチを提供した.
- 細菌刺激に対する dendritic 細胞の反応の高度な理解.
