高通量画像マッピングを用いた遺伝子位置決定因子の特定
Sigal Shachar1, Ty C Voss2, Gianluca Pegoraro2
1National Cancer Institute, NIH, Bethesda, MD 20892, USA.
Cell
|August 16, 2015
まとめ
3次元細胞核のゲノム組織をマッピングする ハイ・スループット・イメージング・パイプライン HIPMapを開発しました この方法は,正しい空間的ゲノム位置づけを維持するために不可欠な50の新しい要因を特定しました.
科学分野:
- 細胞生物学
- ゲノミクス
- 分子生物学
背景:
- ゲノムは細胞核の3次元空間で ランダムに編成されていません
- ゲノム組織を理解することは 細胞機能の鍵です
研究 の 目的:
- ゲノム領域の位置をマッピングするための高通量メソッドを開発する.
- 空間的なゲノム組織に関与する細胞因子を特定する.
主な方法:
- HIPMap (高精度,高通量,自動化光インシチューハイブリッド化イメージングパイプライン) を開発.
- 人間の細胞における偏見のないsiRNAスクリーンを用いたHIPMap.
- 多様なゲノムロキの空間的な位置をマッピングした.
主要な成果:
- 適切なゲノム配置に不可欠な 50の細胞因子を特定しました
- 定位因子には,クロマチンの改造剤,ヒストンの改変剤,核タンパク質が含まれます.
- 複製とクロマチンの再組み立ての部品は,重要な位置付け要因です.
- 遺伝子の位置づけにはミトーシスではなく複製による細胞サイクル進行が重要です.
結論:
- HIPMapは,ゲノム位置をマッピングするための大規模な方法を提供します.
- 空間的ゲノム組織に関与する細胞因子の要約が特定されました.
- この研究は ゲノム構造の基礎にある 分子機構の理解を進めるものです
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