急性呼吸障害症候群における中性粒子の全ゲノム転写プロファイリング

科学分野:

• 肺医学
• 免疫学
• ゲノミクス

背景:

• 急性呼吸器不全症候群 (ARDS) は,中性粒子を駆動する肺炎によって特徴付けられます.
• ARDS患者におけるポリモルフォ核白血球 (PMN) は活性化,酸化爆発,生存の変化を示します.
• ARDS PMN機能障害の分子基礎は,まだ完全に理解されていません.

研究 の 目的:

• ARDS患者の血液PMNの全ゲノムトランスクリプションプロフィールを調査する.
• ARDS PMNの機能と長寿を支える分子メカニズムを特定する.
• ARDSにおけるPMNの行動を操作するための潜在的な治療目標を発見する.

主な方法:

• アフィメトリックスオリゴヌクレオチド配列を用いた全遺伝子発現プロファイリングは,ARDS患者 (n=10) と健康な対照群 (n=10) の高度に純粋なPMNを用いた.
• in vitro rhGM-CSF刺激による健康なPMNとの比較
• Ingenuity Pathway Analysisソフトウェアを使用した経路分析.

主要な成果:

• 1319の遺伝子は,健康な対照群と比較して,ARDS PMNで差異的に発現した.
• ARDS PMNの遺伝子発現プロファイルは,セプシスや灼熱患者のデータセットと強く相関していました.
• ARDS PMNの濃縮されたトランスクリプトは,がん,細胞破壊,アポトーシス,およびケモタキシに関与する経路にマッピングされています.

結論:

• この研究は,高度に純粋なARDS血液PMNの最初のグローバルなゲノムプロファイリングを提供します.
• ARDS PMNは,以前に観察された異常な機能と生存と相関する重要なde novo転写活性を示しています.
• ARDS PMNのトランスクリプトミカルシグネチャーは,rhGM-CSF刺激 PMNと重なり合っているが,セプシスや灼傷と密接に似ています.