コメントへの返信 "統計的分割は,鳥類の樹の正確な結合ベースの推定を可能にします"

Siavash Mirarab¹, Md Shamsuzzoha Bayzid², Bastien Boussau³

¹Department of Computer Science, University of Texas at Austin, Austin, TX, USA. Department of Electrical and Computer Engineering, University of California at San Diego, San Diego, CA, USA.

Science (New York, N.Y.)

|October 10, 2015

まとめ

この研究は,種の木の見積もりに対する加重された統計的分類に対する主張を否定している. 私たちの分析は,以前の数学的な議論とシミュレーション方法が欠陥があり,この技術に対して偏った結果をもたらしました.

科学分野:

系統遺伝学
コンピュータ生物学
統計モデリング

背景:

統計的に加重された分類は,遺伝学的な分析で使用される方法である.
劉とエドワーズの最近の研究では樹種を推定する際の有用性について疑問を投げかけました

研究の目的:

リュウとエドワーズが指摘した重み付けされた統計的分類に関する批判を解決する.
種の樹木の推定における加重された統計的分割の妥当性と有効性を実証する.

主な方法:

数学的に重み付けされた統計的分類に反対する議論を再評価する.
劉とエドワーズが使用したシミュレーション研究方法論の分析.
修正された統計的分割プロトコルを使用した結果の比較

主要な成果:

LiuとEdwardsが提示した数学的な議論は,加重された統計的ビンリングには適用できません.
劉とエドワーズのシミュレーション研究は標準的なプロトコルから逸脱し偏ったデータを使用しました
統計的なバインリングを正しく適用すると,有効な結果が得られます.

結論:

有効かつ有効な方法として,種の樹木を推定しています.
劉とエドワーズの批判は欠陥のある数学的推論とシミュレーション方法に基づいています
遺伝学的な方法を評価するために標準化されたプロトコルを使用する研究が必要です.

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