人間 の 転写 因子 の 変化 を 調査 する と,DNA の 結合 度 が 変化 し て いる こと が 明らか に なり ます
Luis A Barrera1,2,3,4, Anastasia Vedenko1, Jesse V Kurland1
1Division of Genetics, Department of Medicine, Brigham and Women's Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA.
ほとんどの人は遺伝的変異により独特の転写因子 (TF) DNA結合活動を持っています. この研究は,TFの変種を調査した.
科学分野:
- 遺伝学
- 分子生物学
- バイオ情報学
背景:
- 遺伝的配列はヒトの転写因子 (TF) の多くの変異を明らかにする.
- これらのTF遺伝子変異がDNA結合に与える機能的な影響は,ほとんど不明である.
- これらの多様性を理解することは 人間の遺伝的多様性や病気の解釈に不可欠です
研究 の 目的:
- 遺伝子変異がヒトの転写因子DNA結合活動に及ぼす影響を計算および実験的に評価する.
- DNA結合の親和性や特異性を変化させる特定のTF変種を特定する.
- TF結合変異の有病率と潜在的な現象的影響を調査する.
主な方法:
- TF変種がDNA結合に与える影響を予測する計算的,構造ベースの方法を開発した.
- 配列特異のDNA結合活性を実験的に測定するために,普遍的なタンパク質結合マイクロ配列を使用した.
- 異なる集団とメンデルの病気のコホートから41の参照および117の変異TFアレルを測定した.
主要な成果:
- TF DNAの結合親和性または特異性に有意な影響を及ぼす28の遺伝子に77の変種が特定されました.
- ヒトの配列特異性TFのDNA結合活動を変化させると予測される数千の希少遺伝子アレルを発見した.
- ほとんどの個体が特異なTFDNA結合レパートリーを持っていることが示された.
結論:
- 転写因子の遺伝的変異は,そのDNA結合能力を頻繁に変化させる.
- これらのTFDNA結合活性の変化は一般的であり,個々の表型差異に寄与する可能性があります.
- この研究は,TF機能に対する遺伝子変異の機能的影響を評価するための枠組みを提供する.
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