プロテオゲノミクスは,体内の変異を乳がんのシグナル伝達と関連付けている

科学分野:

• 腫瘍学
• ゲノミクス
• プロテオミクス

背景:

• 乳がんにおける体内変異は知られているが,そのタンパク質学的影響は不明である.
• これらのプロテオミクスの変化を理解することは ターゲットを絞った治療法にとって極めて重要です

研究 の 目的:

• 乳がんにおける体変異のプロテオミクとフォスフォプロテオミクの結果を調査する.
• ゲノムとプロテオミクスのデータを統合することによって,新しい治療標的を特定する.

主な方法:

• 定量質スペクトロメトリーに基づくプロテオミクおよびフォスフォプロテオミク分析は,乳がんのサンプル105件で行われました.
• 統合した分析では,ゲノムデータとタンパク質およびフォスフォプロテオミクプロファイルを組み合わせた.
• 統合ネットワークベースのセルラーシグネチャのライブラリがトランス効果を尋問するために使用されました.

主要な成果:

• 塩基性乳がんにおける5q消去のような染色体喪失は,特定のタンパク質発現の変化 (EGFR,SRCなど) と関連していた.
• プロテオミクスのデータは,ストロマに富んだタンパク質と,フォスフォプロテオームのGタンパク質結合受容体クラスタを含む明確なクラスタを明らかにした.
• アンプリカンに関連したいくつかのキナーゼ (例えば,CDK12,PAK1) は,高度にリン酸化されていると特定されました.

結論:

• プロテオゲノム分析は,乳がんにおける体内の変異の機能的影響を効果的に明らかにします.
• このアプローチは,ゲノム変異の内にある駆動遺伝子を特定し,新しい治療標的を発見するのに役立ちます.