マルチプレキスされたレポーターアッセイを用いた数百の表現調節変数の直接識別

科学分野:

• ゲノミクス
• 分子生物学
• 人間 の 遺伝子

背景:

• ヒトの特徴や病気の因果性アレルを特定することは,特にコード化しない変異種には困難です.
• ヒトの特徴や病気に関連する 遺伝的位置は何百個も特定されていますが 特定の因果的な変異を特定することは依然として大きな障害です
• 遺伝子の調節と病気において,コード化されていない変種は重要な役割を果たしますが,その機能的影響はしばしば確認することが困難です.

研究 の 目的:

• 遺伝子発現を直接調節する変種を特定するために,大量並列レポーター測定法 (MPRA) を適応して適用する.
• ヒトの特徴や病気に関連した因果的なアレル,特に非コーディングの変異を特定する.
• 機能的な遺伝子変異のリソースを作成し,非コーディングポリモルフィズムを尋問する際にMPRAの有用性を実証します.

主な方法:

• 遺伝子変異の制御機能を評価するために,大量並列レポーターアッセイ (MPRA) の適応.
• 3,642のシス表現定量特征ロシ (eQTL) と対照領域からの32,373の変種にMPRAの適用.
• MPRAの検出と規制機能の確立された測定値の相関分析

主要な成果:

• MPRAの検出は,規制機能の測定値と強い相関性を示した.
• 異なるアレル特異的な発現を示す842の変種を特定した.
• 疾患と特徴に関連した53のよく注釈された変種が発見され,アンキロージングスポンジライトに関連したプロスタグランジンEP4受容体発現に影響を与える非コーディング変種が含まれています.

結論:

• MPRAは因果的なアレル,特に遺伝子発現を調節する非コーディングの変異を特定するための強力なツールです.
• この研究は,ヒトの生物学と病気を理解するための潜在的な意味を持つ機能的な変異の貴重なリソースを提供します.
• このアプローチは,人間の健康と病気における非コーディングポリモルフィズムの役割を包括的に調査するための有望な戦略を提供します.