トリメチルシンを含有するヒストンペプチドの超分子親和性標識とヒストンデアセチラーゼ試験への適用
Isaiah N Gober1, Marcey L Waters1
1Department of Chemistry, CB 3290, UNC Chapel Hill , Chapel Hill, North Carolina 27599, United States.
Journal of the American Chemical Society
|July 9, 2016
まとめ
研究者らはヒストンペプチドのトリメチルライシン (Kme3) を検出するための新しい化学探査機を開発しました. この光ラベルメソッドは選択的な検出を可能にし,酵素活性と薬物スクリーニングのための新しい測定法を提供します.
科学分野:
- 化学生物学
- エピジェネティクス
- 生物化学
背景:
- リシンメチル化は,遺伝子調節と疾患に関与する重要なヒストンの翻訳後の改変 (PTM) である.
- マススペクトロメトリーや抗体などのライシンメチル化検出の現在の方法は,限界があります.
- リジンメチル化のようなPTMを検知するための選択的化学方法が必要である.
研究 の 目的:
- トリメチルライシン (Kme3) の選択的化学検出のための新しい合成受容体探査機を開発する.
- この探査機が 生物化学実験に 役立つことを示すためだ
主な方法:
- トリメチルライシン (Kme3) に特異的に結合するように設計された合成受容体探査機CX4-ONBDの開発.
- 従来のパラダイムを逆転させ,リガンド指向のアフィニティラベリングのための超分子アプローチを使用した.
- 非メチル化ライシンペプチドに対するKme3改変ペプチドに対する探査機の光反応と選択性を評価した.
主要な成果:
- CX4-ONBD探査機は,Kme3ヒストンペプチドと結合すると強力な"オン"光反応を示した.
- 非メチル化ライシンペプチドと比較して,Kme3ペプチドの共性ラベリングで5倍以上の選択性を達成した.
- ヒストン脱酸化酵素 (HDAC) 活性と阻害剤のスクリーニングのための光測定法を作成するために,プローブを成功裏に適用しました.
結論:
- 合成受容体媒介の親和性ラベリングアプローチは,PTM検出のための新しい化学的ツールを提供します.
- この方法は,ライシンメチル化やその他のPTMを検出する能力を拡大します.
- 開発された探査機と測定プラットフォームは,多用途の in vitro 酵素測定の作成を容易にする.
さらに関連する動画
12:07Sequence-specific Labeling of Nucleic Acids and Proteins with Methyltransferases and Cofactor Analogues
Published on: November 22, 2014
14.5K
07:26Site Specific Lysine Acetylation of Histones for Nucleosome Reconstitution using Genetic Code Expansion in Escherichia coli
Published on: December 26, 2020
4.5K
関連する概念動画
Histone Modification
16.9K
The histone proteins have a flexible N-terminal tail extending out from the nucleosome. These histone tails are often subjected to post-translational modifications such as acetylation, methylation, phosphorylation, and ubiquitination. Particular combinations of these modifications form “histone codes” that influence the chromatin folding and tissue-specific gene expression.
Acetylation
The enzyme histone acetyltransferase adds acetyl group to the histones. Another enzyme, histone...
Acetylation
The enzyme histone acetyltransferase adds acetyl group to the histones. Another enzyme, histone...
16.9K
Labeling DNA Probes
9.7K
DNA probes are fragments of DNA labeled with a reporter tag to enable their detection or purification. The resulting labeled DNA probes can then hybridize to target nucleic acid sequences through complementary base-pairing, and may be used to recover or identify these regions.
Radioisotopes, fluorophores, or small molecule binding partners like biotin or digoxigenin, are the most widely used reporter tags for labeling DNA probes. These labels can be attached to the probe DNA molecule via...
Radioisotopes, fluorophores, or small molecule binding partners like biotin or digoxigenin, are the most widely used reporter tags for labeling DNA probes. These labels can be attached to the probe DNA molecule via...
9.7K
