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リボソームスキャンとリサイクルの動態は,翻訳複合プロファイリングによって明らかになった.

Nature +

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2016年7月21日

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2016年7月21日

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まとめ

この要約は機械生成です。

研究者は,メッセンジャーRNA (mRNA) の翻訳動態を酵母菌で観察するために,トランスレーション複合プロファイルシーケンシング (TCP-seq) を使用した. この方法は,リボソームのスキャンとイニシアチブを視覚化して,トランスレーションの調節のためのインビボ証拠を提供します.

科学分野

  • 分子生物学
  • 遺伝学
  • 生物化学

背景

  • メッセンジャーRNA (mRNA) の翻訳は,真核生物の遺伝子発現に不可欠である.
  • 規制はしばしば5'未翻訳領域 (UTR) のリボソームスキャンを含む翻訳開始を対象としています.
  • 以前の方法では 初期翻訳の中間要素を捉えることができず 初期化のダイナミックな側面を推測として残しました

研究 の 目的

  • 生きた酵母細胞の完全な変換サイクルのダイナミクスを明らかにします
  • トランスレーションの開始と終了のメカニズムモデルのための全ゲノム内での証拠を提供すること.
  • 細胞の様々な状況や疾患における翻訳動態の研究方法の確立.

主な方法

  • リボソームプロファイルの進歩である翻訳複合プロファイルシーケンシング (TCP-seq) を開発し,利用した.
  • スキャンを記録するために5'のUTRに沿った小さなサブユニット (SSU) の足跡を観察した.
  • スタートコドンにおける初期複合体の形状の変化と,ストップコドンにおけるSSUの振る舞いを視覚化した.

主要な成果

  • 出口チャネル経由でmRNAの相互作用を示唆する拡張足跡を持つ5' UTRでのSSUスキャンが文書化されています.
  • スタートコドンで異なるSSUの足跡サイズを視覚化し,スタートコドン認識に関連した形状の変化を示します.
  • 大型サブユニット (LSU) の出発後のストップコドンで観測されたSSU"リンガーリング"

結論

  • TCP-seqは,翻訳開始と終了モデルを支える直接的な全ゲノム内での証拠を提供します.
  • この方法は,トランスレーションサイクル全体でリボソーム複合体を捕捉し,多様な細胞文脈での研究を支援します.
  • TCP-seqは,mRNA特異的な発起差異を疾患および治療応答で識別するのに役立ちます.SSUスキャンは,抗がん薬の開発のターゲットです.

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